Protein–RNA interactions for Protein: J9JI28

Vwa3b, von Willebrand factor A domain-containing 3B, mousemouse

Predictions only

Length 736 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vwa3bJ9JI28 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Vwa3bJ9JI28 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Vwa3bJ9JI28 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Vwa3bJ9JI28 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Vwa3bJ9JI28 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Vwa3bJ9JI28 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Vwa3bJ9JI28 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Vwa3bJ9JI28 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Vwa3bJ9JI28 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
Vwa3bJ9JI28 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Vwa3bJ9JI28 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Vwa3bJ9JI28 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Vwa3bJ9JI28 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Vwa3bJ9JI28 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Vwa3bJ9JI28 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Vwa3bJ9JI28 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Vwa3bJ9JI28 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Vwa3bJ9JI28 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Vwa3bJ9JI28 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Vwa3bJ9JI28 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Vwa3bJ9JI28 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Vwa3bJ9JI28 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Vwa3bJ9JI28 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Vwa3bJ9JI28 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Vwa3bJ9JI28 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Vwa3bJ9JI28 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Vwa3bJ9JI28 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Vwa3bJ9JI28 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Vwa3bJ9JI28 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Vwa3bJ9JI28 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Vwa3bJ9JI28 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Vwa3bJ9JI28 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Vwa3bJ9JI28 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
Vwa3bJ9JI28 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Vwa3bJ9JI28 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Vwa3bJ9JI28 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
Vwa3bJ9JI28 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
Vwa3bJ9JI28 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Vwa3bJ9JI28 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
Vwa3bJ9JI28 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Vwa3bJ9JI28 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Vwa3bJ9JI28 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Vwa3bJ9JI28 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Vwa3bJ9JI28 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Vwa3bJ9JI28 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Vwa3bJ9JI28 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Vwa3bJ9JI28 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Vwa3bJ9JI28 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Vwa3bJ9JI28 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
Vwa3bJ9JI28 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Vwa3bJ9JI28 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Vwa3bJ9JI28 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Vwa3bJ9JI28 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Vwa3bJ9JI28 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Vwa3bJ9JI28 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Vwa3bJ9JI28 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Vwa3bJ9JI28 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Vwa3bJ9JI28 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
Vwa3bJ9JI28 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
Vwa3bJ9JI28 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Vwa3bJ9JI28 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Vwa3bJ9JI28 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Vwa3bJ9JI28 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Vwa3bJ9JI28 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Vwa3bJ9JI28 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Vwa3bJ9JI28 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Vwa3bJ9JI28 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Vwa3bJ9JI28 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Vwa3bJ9JI28 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Vwa3bJ9JI28 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Vwa3bJ9JI28 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Vwa3bJ9JI28 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Vwa3bJ9JI28 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Vwa3bJ9JI28 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Vwa3bJ9JI28 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Vwa3bJ9JI28 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Vwa3bJ9JI28 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Vwa3bJ9JI28 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Vwa3bJ9JI28 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Vwa3bJ9JI28 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Vwa3bJ9JI28 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Vwa3bJ9JI28 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Vwa3bJ9JI28 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Vwa3bJ9JI28 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Vwa3bJ9JI28 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Vwa3bJ9JI28 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Vwa3bJ9JI28 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Vwa3bJ9JI28 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Vwa3bJ9JI28 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Vwa3bJ9JI28 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Vwa3bJ9JI28 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Vwa3bJ9JI28 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Vwa3bJ9JI28 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Vwa3bJ9JI28 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
Vwa3bJ9JI28 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Vwa3bJ9JI28 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Vwa3bJ9JI28 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Vwa3bJ9JI28 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Vwa3bJ9JI28 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Vwa3bJ9JI28 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.3 ms