Protein–RNA interactions for Protein: J3QPW6

1700122O11Rik, MCG53587, mousemouse

Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700122O11RikJ3QPW6 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
1700122O11RikJ3QPW6 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
1700122O11RikJ3QPW6 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
1700122O11RikJ3QPW6 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
1700122O11RikJ3QPW6 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
1700122O11RikJ3QPW6 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
1700122O11RikJ3QPW6 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
1700122O11RikJ3QPW6 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
1700122O11RikJ3QPW6 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
1700122O11RikJ3QPW6 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
1700122O11RikJ3QPW6 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
1700122O11RikJ3QPW6 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
1700122O11RikJ3QPW6 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
1700122O11RikJ3QPW6 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
1700122O11RikJ3QPW6 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
1700122O11RikJ3QPW6 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
1700122O11RikJ3QPW6 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
1700122O11RikJ3QPW6 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
1700122O11RikJ3QPW6 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
1700122O11RikJ3QPW6 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
1700122O11RikJ3QPW6 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
1700122O11RikJ3QPW6 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
1700122O11RikJ3QPW6 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
1700122O11RikJ3QPW6 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
1700122O11RikJ3QPW6 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
1700122O11RikJ3QPW6 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
1700122O11RikJ3QPW6 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
1700122O11RikJ3QPW6 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
1700122O11RikJ3QPW6 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
1700122O11RikJ3QPW6 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
1700122O11RikJ3QPW6 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
1700122O11RikJ3QPW6 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
1700122O11RikJ3QPW6 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
1700122O11RikJ3QPW6 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
1700122O11RikJ3QPW6 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
1700122O11RikJ3QPW6 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
1700122O11RikJ3QPW6 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
1700122O11RikJ3QPW6 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
1700122O11RikJ3QPW6 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
1700122O11RikJ3QPW6 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
1700122O11RikJ3QPW6 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
1700122O11RikJ3QPW6 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
1700122O11RikJ3QPW6 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
1700122O11RikJ3QPW6 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
1700122O11RikJ3QPW6 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
1700122O11RikJ3QPW6 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
1700122O11RikJ3QPW6 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
1700122O11RikJ3QPW6 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
1700122O11RikJ3QPW6 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
1700122O11RikJ3QPW6 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
1700122O11RikJ3QPW6 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
1700122O11RikJ3QPW6 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
1700122O11RikJ3QPW6 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
1700122O11RikJ3QPW6 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
1700122O11RikJ3QPW6 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
1700122O11RikJ3QPW6 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
1700122O11RikJ3QPW6 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
1700122O11RikJ3QPW6 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
1700122O11RikJ3QPW6 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
1700122O11RikJ3QPW6 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
1700122O11RikJ3QPW6 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
1700122O11RikJ3QPW6 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
1700122O11RikJ3QPW6 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
1700122O11RikJ3QPW6 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
1700122O11RikJ3QPW6 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
1700122O11RikJ3QPW6 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
1700122O11RikJ3QPW6 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
1700122O11RikJ3QPW6 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
1700122O11RikJ3QPW6 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
1700122O11RikJ3QPW6 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
1700122O11RikJ3QPW6 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
1700122O11RikJ3QPW6 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
1700122O11RikJ3QPW6 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
1700122O11RikJ3QPW6 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
1700122O11RikJ3QPW6 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
1700122O11RikJ3QPW6 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
1700122O11RikJ3QPW6 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
1700122O11RikJ3QPW6 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
1700122O11RikJ3QPW6 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
1700122O11RikJ3QPW6 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
1700122O11RikJ3QPW6 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
1700122O11RikJ3QPW6 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
1700122O11RikJ3QPW6 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
1700122O11RikJ3QPW6 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
1700122O11RikJ3QPW6 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
1700122O11RikJ3QPW6 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
1700122O11RikJ3QPW6 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
1700122O11RikJ3QPW6 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
1700122O11RikJ3QPW6 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
1700122O11RikJ3QPW6 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
1700122O11RikJ3QPW6 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
1700122O11RikJ3QPW6 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
1700122O11RikJ3QPW6 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
1700122O11RikJ3QPW6 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.84■■□□□ 1.09
1700122O11RikJ3QPW6 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
1700122O11RikJ3QPW6 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
1700122O11RikJ3QPW6 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
1700122O11RikJ3QPW6 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
1700122O11RikJ3QPW6 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
1700122O11RikJ3QPW6 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.1 ms