Protein–RNA interactions for Protein: J3QPU5

Ccer2, Coiled-coil glutamate-rich protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 274 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccer2J3QPU5 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.38■■■□□ 2.93
Ccer2J3QPU5 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC33.38■■■□□ 2.93
Ccer2J3QPU5 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.38■■■□□ 2.93
Ccer2J3QPU5 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC33.38■■■□□ 2.93
Ccer2J3QPU5 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
Ccer2J3QPU5 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.37■■■□□ 2.93
Ccer2J3QPU5 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
Ccer2J3QPU5 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC33.36■■■□□ 2.93
Ccer2J3QPU5 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
Ccer2J3QPU5 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC33.36■■■□□ 2.93
Ccer2J3QPU5 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC33.36■■■□□ 2.93
Ccer2J3QPU5 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
Ccer2J3QPU5 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
Ccer2J3QPU5 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
Ccer2J3QPU5 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
Ccer2J3QPU5 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC33.33■■■□□ 2.93
Ccer2J3QPU5 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
Ccer2J3QPU5 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC33.32■■■□□ 2.92
Ccer2J3QPU5 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC33.32■■■□□ 2.92
Ccer2J3QPU5 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
Ccer2J3QPU5 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
Ccer2J3QPU5 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC33.32■■■□□ 2.92
Ccer2J3QPU5 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
Ccer2J3QPU5 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC33.31■■■□□ 2.92
Ccer2J3QPU5 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
Ccer2J3QPU5 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
Ccer2J3QPU5 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC33.3■■■□□ 2.92
Ccer2J3QPU5 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
Ccer2J3QPU5 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
Ccer2J3QPU5 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
Ccer2J3QPU5 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
Ccer2J3QPU5 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
Ccer2J3QPU5 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
Ccer2J3QPU5 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
Ccer2J3QPU5 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.92
Ccer2J3QPU5 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC33.26■■■□□ 2.92
Ccer2J3QPU5 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.92
Ccer2J3QPU5 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.92
Ccer2J3QPU5 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC33.26■■■□□ 2.91
Ccer2J3QPU5 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.91
Ccer2J3QPU5 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC33.26■■■□□ 2.91
Ccer2J3QPU5 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC33.25■■■□□ 2.91
Ccer2J3QPU5 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC33.25■■■□□ 2.91
Ccer2J3QPU5 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.24■■■□□ 2.91
Ccer2J3QPU5 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
Ccer2J3QPU5 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC33.23■■■□□ 2.91
Ccer2J3QPU5 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
Ccer2J3QPU5 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
Ccer2J3QPU5 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC33.21■■■□□ 2.91
Ccer2J3QPU5 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
Ccer2J3QPU5 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
Ccer2J3QPU5 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
Ccer2J3QPU5 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
Ccer2J3QPU5 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
Ccer2J3QPU5 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
Ccer2J3QPU5 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
Ccer2J3QPU5 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
Ccer2J3QPU5 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
Ccer2J3QPU5 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC33.17■■■□□ 2.9
Ccer2J3QPU5 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC33.17■■■□□ 2.9
Ccer2J3QPU5 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC33.17■■■□□ 2.9
Ccer2J3QPU5 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.16■■■□□ 2.9
Ccer2J3QPU5 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
Ccer2J3QPU5 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC33.16■■■□□ 2.9
Ccer2J3QPU5 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.16■■■□□ 2.9
Ccer2J3QPU5 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
Ccer2J3QPU5 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
Ccer2J3QPU5 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
Ccer2J3QPU5 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
Ccer2J3QPU5 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
Ccer2J3QPU5 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
Ccer2J3QPU5 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
Ccer2J3QPU5 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
Ccer2J3QPU5 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC33.13■■■□□ 2.89
Ccer2J3QPU5 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC33.12■■■□□ 2.89
Ccer2J3QPU5 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
Ccer2J3QPU5 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
Ccer2J3QPU5 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
Ccer2J3QPU5 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
Ccer2J3QPU5 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
Ccer2J3QPU5 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.09■■■□□ 2.89
Ccer2J3QPU5 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
Ccer2J3QPU5 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
Ccer2J3QPU5 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
Ccer2J3QPU5 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC33.07■■■□□ 2.88
Ccer2J3QPU5 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
Ccer2J3QPU5 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC33.06■■■□□ 2.88
Ccer2J3QPU5 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC33.06■■■□□ 2.88
Ccer2J3QPU5 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC33.05■■■□□ 2.88
Ccer2J3QPU5 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
Ccer2J3QPU5 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
Ccer2J3QPU5 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
Ccer2J3QPU5 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.03■■■□□ 2.88
Ccer2J3QPU5 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
Ccer2J3QPU5 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
Ccer2J3QPU5 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
Ccer2J3QPU5 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC33.02■■■□□ 2.88
Ccer2J3QPU5 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
Ccer2J3QPU5 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.02■■■□□ 2.88
Ccer2J3QPU5 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.4 ms