Protein–RNA interactions for Protein: J3KMS0

Gm21411, Predicted gene, 21411, mousemouse

Predictions only

Length 136 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21411J3KMS0 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Gm21411J3KMS0 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Gm21411J3KMS0 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Gm21411J3KMS0 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Gm21411J3KMS0 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Gm21411J3KMS0 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Gm21411J3KMS0 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Gm21411J3KMS0 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC20.33■□□□□ 0.84
Gm21411J3KMS0 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Gm21411J3KMS0 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Gm21411J3KMS0 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gm21411J3KMS0 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gm21411J3KMS0 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gm21411J3KMS0 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gm21411J3KMS0 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gm21411J3KMS0 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gm21411J3KMS0 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gm21411J3KMS0 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gm21411J3KMS0 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gm21411J3KMS0 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gm21411J3KMS0 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gm21411J3KMS0 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gm21411J3KMS0 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gm21411J3KMS0 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gm21411J3KMS0 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gm21411J3KMS0 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gm21411J3KMS0 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gm21411J3KMS0 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gm21411J3KMS0 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gm21411J3KMS0 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gm21411J3KMS0 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Gm21411J3KMS0 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Gm21411J3KMS0 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Gm21411J3KMS0 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Gm21411J3KMS0 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Gm21411J3KMS0 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Gm21411J3KMS0 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Gm21411J3KMS0 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Gm21411J3KMS0 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Gm21411J3KMS0 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Gm21411J3KMS0 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Gm21411J3KMS0 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Gm21411J3KMS0 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Gm21411J3KMS0 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Gm21411J3KMS0 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Gm21411J3KMS0 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Gm21411J3KMS0 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Gm21411J3KMS0 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Gm21411J3KMS0 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Gm21411J3KMS0 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Gm21411J3KMS0 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Gm21411J3KMS0 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Gm21411J3KMS0 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Gm21411J3KMS0 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Gm21411J3KMS0 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Gm21411J3KMS0 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Gm21411J3KMS0 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Gm21411J3KMS0 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Gm21411J3KMS0 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Gm21411J3KMS0 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Gm21411J3KMS0 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Gm21411J3KMS0 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Gm21411J3KMS0 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Gm21411J3KMS0 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Gm21411J3KMS0 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gm21411J3KMS0 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gm21411J3KMS0 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gm21411J3KMS0 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gm21411J3KMS0 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gm21411J3KMS0 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gm21411J3KMS0 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gm21411J3KMS0 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gm21411J3KMS0 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gm21411J3KMS0 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gm21411J3KMS0 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gm21411J3KMS0 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gm21411J3KMS0 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Gm21411J3KMS0 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gm21411J3KMS0 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gm21411J3KMS0 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Gm21411J3KMS0 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gm21411J3KMS0 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gm21411J3KMS0 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Gm21411J3KMS0 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Gm21411J3KMS0 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gm21411J3KMS0 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gm21411J3KMS0 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gm21411J3KMS0 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gm21411J3KMS0 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gm21411J3KMS0 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gm21411J3KMS0 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gm21411J3KMS0 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gm21411J3KMS0 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gm21411J3KMS0 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gm21411J3KMS0 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gm21411J3KMS0 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gm21411J3KMS0 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gm21411J3KMS0 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gm21411J3KMS0 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Gm21411J3KMS0 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.5 ms