Protein–RNA interactions for Protein: G5E8X2

Pabpc4l, MCG12357, mousemouse

Predictions only

Length 370 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pabpc4lG5E8X2 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Pabpc4lG5E8X2 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Pabpc4lG5E8X2 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Pabpc4lG5E8X2 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Pabpc4lG5E8X2 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Pabpc4lG5E8X2 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Pabpc4lG5E8X2 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Pabpc4lG5E8X2 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Pabpc4lG5E8X2 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Pabpc4lG5E8X2 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
Pabpc4lG5E8X2 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Pabpc4lG5E8X2 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Pabpc4lG5E8X2 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Pabpc4lG5E8X2 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Pabpc4lG5E8X2 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Pabpc4lG5E8X2 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Pabpc4lG5E8X2 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Pabpc4lG5E8X2 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Pabpc4lG5E8X2 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Pabpc4lG5E8X2 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Pabpc4lG5E8X2 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Pabpc4lG5E8X2 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Pabpc4lG5E8X2 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Pabpc4lG5E8X2 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Pabpc4lG5E8X2 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Pabpc4lG5E8X2 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Pabpc4lG5E8X2 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Pabpc4lG5E8X2 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Pabpc4lG5E8X2 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Pabpc4lG5E8X2 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Pabpc4lG5E8X2 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Pabpc4lG5E8X2 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Pabpc4lG5E8X2 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Pabpc4lG5E8X2 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Pabpc4lG5E8X2 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Pabpc4lG5E8X2 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Pabpc4lG5E8X2 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Pabpc4lG5E8X2 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Pabpc4lG5E8X2 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Pabpc4lG5E8X2 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Pabpc4lG5E8X2 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Pabpc4lG5E8X2 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Pabpc4lG5E8X2 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Pabpc4lG5E8X2 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Pabpc4lG5E8X2 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Pabpc4lG5E8X2 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Pabpc4lG5E8X2 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Pabpc4lG5E8X2 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Pabpc4lG5E8X2 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Pabpc4lG5E8X2 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Pabpc4lG5E8X2 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Pabpc4lG5E8X2 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Pabpc4lG5E8X2 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Pabpc4lG5E8X2 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Pabpc4lG5E8X2 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Pabpc4lG5E8X2 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Pabpc4lG5E8X2 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Pabpc4lG5E8X2 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Pabpc4lG5E8X2 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Pabpc4lG5E8X2 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Pabpc4lG5E8X2 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Pabpc4lG5E8X2 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Pabpc4lG5E8X2 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Pabpc4lG5E8X2 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Pabpc4lG5E8X2 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Pabpc4lG5E8X2 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Pabpc4lG5E8X2 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Pabpc4lG5E8X2 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Pabpc4lG5E8X2 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Pabpc4lG5E8X2 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Pabpc4lG5E8X2 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Pabpc4lG5E8X2 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Pabpc4lG5E8X2 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Pabpc4lG5E8X2 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Pabpc4lG5E8X2 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Pabpc4lG5E8X2 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Pabpc4lG5E8X2 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Pabpc4lG5E8X2 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Pabpc4lG5E8X2 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Pabpc4lG5E8X2 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Pabpc4lG5E8X2 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Pabpc4lG5E8X2 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Pabpc4lG5E8X2 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Pabpc4lG5E8X2 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Pabpc4lG5E8X2 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Pabpc4lG5E8X2 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Pabpc4lG5E8X2 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Pabpc4lG5E8X2 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Pabpc4lG5E8X2 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Pabpc4lG5E8X2 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Pabpc4lG5E8X2 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Pabpc4lG5E8X2 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Pabpc4lG5E8X2 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Pabpc4lG5E8X2 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Pabpc4lG5E8X2 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Pabpc4lG5E8X2 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Pabpc4lG5E8X2 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Pabpc4lG5E8X2 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Pabpc4lG5E8X2 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Pabpc4lG5E8X2 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 79.6 ms