Protein–RNA interactions for Protein: G3X9U3

Vmn1r58, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 310 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r58G3X9U3 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Vmn1r58G3X9U3 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Vmn1r58G3X9U3 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Vmn1r58G3X9U3 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Vmn1r58G3X9U3 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Vmn1r58G3X9U3 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Vmn1r58G3X9U3 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Vmn1r58G3X9U3 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Vmn1r58G3X9U3 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Vmn1r58G3X9U3 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Vmn1r58G3X9U3 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Vmn1r58G3X9U3 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Vmn1r58G3X9U3 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Vmn1r58G3X9U3 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Vmn1r58G3X9U3 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Vmn1r58G3X9U3 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Vmn1r58G3X9U3 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Vmn1r58G3X9U3 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Vmn1r58G3X9U3 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Vmn1r58G3X9U3 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Vmn1r58G3X9U3 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Vmn1r58G3X9U3 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Vmn1r58G3X9U3 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Vmn1r58G3X9U3 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Vmn1r58G3X9U3 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Vmn1r58G3X9U3 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Vmn1r58G3X9U3 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Vmn1r58G3X9U3 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Vmn1r58G3X9U3 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Vmn1r58G3X9U3 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Vmn1r58G3X9U3 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Vmn1r58G3X9U3 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Vmn1r58G3X9U3 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Vmn1r58G3X9U3 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Vmn1r58G3X9U3 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Vmn1r58G3X9U3 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Vmn1r58G3X9U3 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Vmn1r58G3X9U3 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Vmn1r58G3X9U3 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Vmn1r58G3X9U3 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Vmn1r58G3X9U3 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Vmn1r58G3X9U3 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Vmn1r58G3X9U3 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Vmn1r58G3X9U3 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Vmn1r58G3X9U3 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Vmn1r58G3X9U3 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Vmn1r58G3X9U3 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Vmn1r58G3X9U3 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Vmn1r58G3X9U3 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Vmn1r58G3X9U3 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Vmn1r58G3X9U3 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Vmn1r58G3X9U3 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
Vmn1r58G3X9U3 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Vmn1r58G3X9U3 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Vmn1r58G3X9U3 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Vmn1r58G3X9U3 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Vmn1r58G3X9U3 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Vmn1r58G3X9U3 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Vmn1r58G3X9U3 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Vmn1r58G3X9U3 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Vmn1r58G3X9U3 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Vmn1r58G3X9U3 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Vmn1r58G3X9U3 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Vmn1r58G3X9U3 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Vmn1r58G3X9U3 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Vmn1r58G3X9U3 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Vmn1r58G3X9U3 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Vmn1r58G3X9U3 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Vmn1r58G3X9U3 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Vmn1r58G3X9U3 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Vmn1r58G3X9U3 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Vmn1r58G3X9U3 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Vmn1r58G3X9U3 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Vmn1r58G3X9U3 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Vmn1r58G3X9U3 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Vmn1r58G3X9U3 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Vmn1r58G3X9U3 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
Vmn1r58G3X9U3 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Vmn1r58G3X9U3 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Vmn1r58G3X9U3 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Vmn1r58G3X9U3 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Vmn1r58G3X9U3 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Vmn1r58G3X9U3 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Vmn1r58G3X9U3 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Vmn1r58G3X9U3 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Vmn1r58G3X9U3 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Vmn1r58G3X9U3 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Vmn1r58G3X9U3 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Vmn1r58G3X9U3 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Vmn1r58G3X9U3 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Vmn1r58G3X9U3 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Vmn1r58G3X9U3 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Vmn1r58G3X9U3 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Vmn1r58G3X9U3 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Vmn1r58G3X9U3 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Vmn1r58G3X9U3 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Vmn1r58G3X9U3 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Vmn1r58G3X9U3 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Vmn1r58G3X9U3 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Vmn1r58G3X9U3 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.7 ms