Protein–RNA interactions for Protein: G3X9M3

Hmgxb3, HMG box domain-containing 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hmgxb3G3X9M3 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Hmgxb3G3X9M3 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Hmgxb3G3X9M3 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Hmgxb3G3X9M3 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Hmgxb3G3X9M3 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Hmgxb3G3X9M3 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Hmgxb3G3X9M3 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Hmgxb3G3X9M3 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Hmgxb3G3X9M3 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Hmgxb3G3X9M3 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Hmgxb3G3X9M3 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Hmgxb3G3X9M3 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Hmgxb3G3X9M3 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Hmgxb3G3X9M3 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Hmgxb3G3X9M3 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Hmgxb3G3X9M3 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Hmgxb3G3X9M3 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Hmgxb3G3X9M3 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Hmgxb3G3X9M3 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Hmgxb3G3X9M3 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Hmgxb3G3X9M3 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Hmgxb3G3X9M3 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Hmgxb3G3X9M3 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Hmgxb3G3X9M3 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Hmgxb3G3X9M3 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Hmgxb3G3X9M3 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Hmgxb3G3X9M3 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Hmgxb3G3X9M3 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Hmgxb3G3X9M3 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Hmgxb3G3X9M3 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Hmgxb3G3X9M3 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Hmgxb3G3X9M3 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Hmgxb3G3X9M3 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Hmgxb3G3X9M3 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Hmgxb3G3X9M3 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Hmgxb3G3X9M3 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Hmgxb3G3X9M3 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Hmgxb3G3X9M3 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Hmgxb3G3X9M3 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Hmgxb3G3X9M3 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Hmgxb3G3X9M3 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Hmgxb3G3X9M3 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Hmgxb3G3X9M3 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Hmgxb3G3X9M3 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Hmgxb3G3X9M3 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Hmgxb3G3X9M3 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Hmgxb3G3X9M3 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Hmgxb3G3X9M3 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Hmgxb3G3X9M3 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Hmgxb3G3X9M3 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Hmgxb3G3X9M3 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Hmgxb3G3X9M3 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Hmgxb3G3X9M3 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Hmgxb3G3X9M3 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Hmgxb3G3X9M3 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Hmgxb3G3X9M3 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Hmgxb3G3X9M3 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Hmgxb3G3X9M3 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Hmgxb3G3X9M3 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Hmgxb3G3X9M3 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Hmgxb3G3X9M3 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Hmgxb3G3X9M3 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Hmgxb3G3X9M3 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Hmgxb3G3X9M3 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Hmgxb3G3X9M3 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Hmgxb3G3X9M3 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Hmgxb3G3X9M3 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Hmgxb3G3X9M3 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Hmgxb3G3X9M3 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Hmgxb3G3X9M3 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Hmgxb3G3X9M3 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Hmgxb3G3X9M3 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Hmgxb3G3X9M3 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Hmgxb3G3X9M3 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Hmgxb3G3X9M3 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Hmgxb3G3X9M3 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Hmgxb3G3X9M3 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Hmgxb3G3X9M3 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Hmgxb3G3X9M3 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Hmgxb3G3X9M3 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Hmgxb3G3X9M3 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Hmgxb3G3X9M3 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Hmgxb3G3X9M3 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Hmgxb3G3X9M3 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Hmgxb3G3X9M3 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Hmgxb3G3X9M3 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Hmgxb3G3X9M3 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Hmgxb3G3X9M3 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Hmgxb3G3X9M3 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Hmgxb3G3X9M3 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Hmgxb3G3X9M3 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Hmgxb3G3X9M3 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Hmgxb3G3X9M3 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Hmgxb3G3X9M3 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Hmgxb3G3X9M3 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Hmgxb3G3X9M3 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Hmgxb3G3X9M3 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Hmgxb3G3X9M3 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Hmgxb3G3X9M3 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Hmgxb3G3X9M3 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.2 ms