Protein–RNA interactions for Protein: G3UVU6

Gm20517, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 20, mousemouse

Predictions only

Length 152 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20517G3UVU6 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gm20517G3UVU6 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gm20517G3UVU6 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gm20517G3UVU6 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gm20517G3UVU6 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gm20517G3UVU6 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gm20517G3UVU6 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gm20517G3UVU6 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Gm20517G3UVU6 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gm20517G3UVU6 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gm20517G3UVU6 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gm20517G3UVU6 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gm20517G3UVU6 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gm20517G3UVU6 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gm20517G3UVU6 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gm20517G3UVU6 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gm20517G3UVU6 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gm20517G3UVU6 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gm20517G3UVU6 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm20517G3UVU6 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm20517G3UVU6 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm20517G3UVU6 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gm20517G3UVU6 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gm20517G3UVU6 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gm20517G3UVU6 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gm20517G3UVU6 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm20517G3UVU6 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm20517G3UVU6 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm20517G3UVU6 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm20517G3UVU6 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm20517G3UVU6 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm20517G3UVU6 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm20517G3UVU6 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm20517G3UVU6 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm20517G3UVU6 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm20517G3UVU6 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm20517G3UVU6 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm20517G3UVU6 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm20517G3UVU6 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gm20517G3UVU6 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gm20517G3UVU6 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gm20517G3UVU6 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gm20517G3UVU6 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gm20517G3UVU6 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gm20517G3UVU6 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gm20517G3UVU6 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm20517G3UVU6 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm20517G3UVU6 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm20517G3UVU6 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm20517G3UVU6 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm20517G3UVU6 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm20517G3UVU6 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm20517G3UVU6 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm20517G3UVU6 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm20517G3UVU6 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm20517G3UVU6 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm20517G3UVU6 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm20517G3UVU6 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm20517G3UVU6 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm20517G3UVU6 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm20517G3UVU6 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm20517G3UVU6 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm20517G3UVU6 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm20517G3UVU6 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm20517G3UVU6 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm20517G3UVU6 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm20517G3UVU6 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm20517G3UVU6 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm20517G3UVU6 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm20517G3UVU6 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm20517G3UVU6 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm20517G3UVU6 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm20517G3UVU6 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm20517G3UVU6 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm20517G3UVU6 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm20517G3UVU6 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm20517G3UVU6 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm20517G3UVU6 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm20517G3UVU6 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm20517G3UVU6 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm20517G3UVU6 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm20517G3UVU6 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm20517G3UVU6 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm20517G3UVU6 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm20517G3UVU6 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm20517G3UVU6 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm20517G3UVU6 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm20517G3UVU6 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm20517G3UVU6 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm20517G3UVU6 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm20517G3UVU6 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm20517G3UVU6 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm20517G3UVU6 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm20517G3UVU6 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm20517G3UVU6 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm20517G3UVU6 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm20517G3UVU6 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gm20517G3UVU6 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gm20517G3UVU6 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gm20517G3UVU6 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11 ms