Protein–RNA interactions for Protein: F8VPZ9

Bicra, BRD4-interacting chromatin-remodeling complex-associated protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,578 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BicraF8VPZ9 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.06■■■■■ 4.48
BicraF8VPZ9 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.03■■■■■ 4.48
BicraF8VPZ9 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC43.02■■■■■ 4.48
BicraF8VPZ9 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC43.02■■■■■ 4.48
BicraF8VPZ9 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC43.02■■■■■ 4.48
BicraF8VPZ9 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.01■■■■■ 4.48
BicraF8VPZ9 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC43■■■■■ 4.47
BicraF8VPZ9 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.99■■■■■ 4.47
BicraF8VPZ9 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC42.99■■■■■ 4.47
BicraF8VPZ9 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC42.99■■■■■ 4.47
BicraF8VPZ9 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC42.98■■■■■ 4.47
BicraF8VPZ9 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC42.98■■■■■ 4.47
BicraF8VPZ9 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC42.98■■■■■ 4.47
BicraF8VPZ9 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.98■■■■■ 4.47
BicraF8VPZ9 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC42.98■■■■■ 4.47
BicraF8VPZ9 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.97■■■■■ 4.47
BicraF8VPZ9 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC42.96■■■■■ 4.47
BicraF8VPZ9 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC42.95■■■■■ 4.47
BicraF8VPZ9 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC42.94■■■■■ 4.47
BicraF8VPZ9 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC42.94■■■■■ 4.47
BicraF8VPZ9 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.94■■■■■ 4.46
BicraF8VPZ9 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.94■■■■■ 4.46
BicraF8VPZ9 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC42.93■■■■■ 4.46
BicraF8VPZ9 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC42.93■■■■■ 4.46
BicraF8VPZ9 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC42.92■■■■■ 4.46
BicraF8VPZ9 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.91■■■■■ 4.46
BicraF8VPZ9 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.91■■■■■ 4.46
BicraF8VPZ9 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.91■■■■■ 4.46
BicraF8VPZ9 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.91■■■■■ 4.46
BicraF8VPZ9 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC42.91■■■■■ 4.46
BicraF8VPZ9 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC42.9■■■■■ 4.46
BicraF8VPZ9 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.9■■■■■ 4.46
BicraF8VPZ9 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC42.89■■■■■ 4.46
BicraF8VPZ9 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.89■■■■■ 4.46
BicraF8VPZ9 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC42.89■■■■■ 4.46
BicraF8VPZ9 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC42.87■■■■■ 4.45
BicraF8VPZ9 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.87■■■■■ 4.45
BicraF8VPZ9 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.87■■■■■ 4.45
BicraF8VPZ9 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC42.87■■■■■ 4.45
BicraF8VPZ9 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.86■■■■■ 4.45
BicraF8VPZ9 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC42.85■■■■■ 4.45
BicraF8VPZ9 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC42.84■■■■■ 4.45
BicraF8VPZ9 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC42.84■■■■■ 4.45
BicraF8VPZ9 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC42.84■■■■■ 4.45
BicraF8VPZ9 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC42.83■■■■■ 4.45
BicraF8VPZ9 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC42.83■■■■■ 4.45
BicraF8VPZ9 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC42.82■■■■■ 4.45
BicraF8VPZ9 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC42.82■■■■■ 4.44
BicraF8VPZ9 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.81■■■■■ 4.44
BicraF8VPZ9 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.81■■■■■ 4.44
BicraF8VPZ9 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC42.81■■■■■ 4.44
BicraF8VPZ9 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.81■■■■■ 4.44
BicraF8VPZ9 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC42.79■■■■■ 4.44
BicraF8VPZ9 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC42.79■■■■■ 4.44
BicraF8VPZ9 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC42.78■■■■■ 4.44
BicraF8VPZ9 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC42.77■■■■■ 4.44
BicraF8VPZ9 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.77■■■■■ 4.44
BicraF8VPZ9 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.77■■■■■ 4.44
BicraF8VPZ9 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC42.76■■■■■ 4.44
BicraF8VPZ9 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.75■■■■■ 4.43
BicraF8VPZ9 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC42.75■■■■■ 4.43
BicraF8VPZ9 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC42.74■■■■■ 4.43
BicraF8VPZ9 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC42.73■■■■■ 4.43
BicraF8VPZ9 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.73■■■■■ 4.43
BicraF8VPZ9 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.72■■■■■ 4.43
BicraF8VPZ9 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC42.71■■■■■ 4.43
BicraF8VPZ9 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC42.71■■■■■ 4.43
BicraF8VPZ9 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.7■■■■■ 4.43
BicraF8VPZ9 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC42.7■■■■■ 4.43
BicraF8VPZ9 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.7■■■■■ 4.43
BicraF8VPZ9 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC42.69■■■■■ 4.43
BicraF8VPZ9 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC42.69■■■■■ 4.42
BicraF8VPZ9 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.69■■■■■ 4.42
BicraF8VPZ9 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.68■■■■■ 4.42
BicraF8VPZ9 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.68■■■■■ 4.42
BicraF8VPZ9 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC42.67■■■■■ 4.42
BicraF8VPZ9 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC42.67■■■■■ 4.42
BicraF8VPZ9 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC42.65■■■■■ 4.42
BicraF8VPZ9 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC42.65■■■■■ 4.42
BicraF8VPZ9 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC42.64■■■■■ 4.42
BicraF8VPZ9 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC42.63■■■■■ 4.42
BicraF8VPZ9 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC42.63■■■■■ 4.42
BicraF8VPZ9 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC42.63■■■■■ 4.41
BicraF8VPZ9 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.62■■■■■ 4.41
BicraF8VPZ9 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.61■■■■■ 4.41
BicraF8VPZ9 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.61■■■■■ 4.41
BicraF8VPZ9 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC42.61■■■■■ 4.41
BicraF8VPZ9 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC42.61■■■■■ 4.41
BicraF8VPZ9 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC42.6■■■■■ 4.41
BicraF8VPZ9 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.6■■■■■ 4.41
BicraF8VPZ9 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC42.59■■■■■ 4.41
BicraF8VPZ9 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.59■■■■■ 4.41
BicraF8VPZ9 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC42.58■■■■■ 4.41
BicraF8VPZ9 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC42.57■■■■■ 4.41
BicraF8VPZ9 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC42.57■■■■■ 4.4
BicraF8VPZ9 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC42.57■■■■■ 4.4
BicraF8VPZ9 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC42.57■■■■■ 4.4
BicraF8VPZ9 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC42.56■■■■■ 4.4
BicraF8VPZ9 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC42.54■■■■■ 4.4
BicraF8VPZ9 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.53■■■■■ 4.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 117.5 ms