Protein–RNA interactions for Protein: F8VPQ2

Arid4a, AT-rich interactive domain 4A (RBP1-like), mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arid4aF8VPQ2 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Arid4aF8VPQ2 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Arid4aF8VPQ2 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Arid4aF8VPQ2 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Arid4aF8VPQ2 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Arid4aF8VPQ2 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Arid4aF8VPQ2 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Arid4aF8VPQ2 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Arid4aF8VPQ2 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Arid4aF8VPQ2 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Arid4aF8VPQ2 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Arid4aF8VPQ2 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Arid4aF8VPQ2 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Arid4aF8VPQ2 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Arid4aF8VPQ2 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Arid4aF8VPQ2 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Arid4aF8VPQ2 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Arid4aF8VPQ2 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Arid4aF8VPQ2 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Arid4aF8VPQ2 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Arid4aF8VPQ2 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Arid4aF8VPQ2 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Arid4aF8VPQ2 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Arid4aF8VPQ2 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Arid4aF8VPQ2 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Arid4aF8VPQ2 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Arid4aF8VPQ2 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Arid4aF8VPQ2 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
Arid4aF8VPQ2 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Arid4aF8VPQ2 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Arid4aF8VPQ2 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
Arid4aF8VPQ2 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Arid4aF8VPQ2 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Arid4aF8VPQ2 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Arid4aF8VPQ2 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Arid4aF8VPQ2 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Arid4aF8VPQ2 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Arid4aF8VPQ2 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Arid4aF8VPQ2 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Arid4aF8VPQ2 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
Arid4aF8VPQ2 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Arid4aF8VPQ2 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Arid4aF8VPQ2 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Arid4aF8VPQ2 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
Arid4aF8VPQ2 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Arid4aF8VPQ2 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Arid4aF8VPQ2 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Arid4aF8VPQ2 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Arid4aF8VPQ2 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Arid4aF8VPQ2 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Arid4aF8VPQ2 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
Arid4aF8VPQ2 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
Arid4aF8VPQ2 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
Arid4aF8VPQ2 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC27.2■■□□□ 1.94
Arid4aF8VPQ2 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Arid4aF8VPQ2 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Arid4aF8VPQ2 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Arid4aF8VPQ2 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Arid4aF8VPQ2 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Arid4aF8VPQ2 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Arid4aF8VPQ2 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Arid4aF8VPQ2 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Arid4aF8VPQ2 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Arid4aF8VPQ2 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Arid4aF8VPQ2 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Arid4aF8VPQ2 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Arid4aF8VPQ2 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Arid4aF8VPQ2 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Arid4aF8VPQ2 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Arid4aF8VPQ2 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Arid4aF8VPQ2 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Arid4aF8VPQ2 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Arid4aF8VPQ2 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Arid4aF8VPQ2 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Arid4aF8VPQ2 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Arid4aF8VPQ2 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Arid4aF8VPQ2 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Arid4aF8VPQ2 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Arid4aF8VPQ2 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Arid4aF8VPQ2 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Arid4aF8VPQ2 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Arid4aF8VPQ2 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Arid4aF8VPQ2 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Arid4aF8VPQ2 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Arid4aF8VPQ2 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Arid4aF8VPQ2 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Arid4aF8VPQ2 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Arid4aF8VPQ2 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Arid4aF8VPQ2 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Arid4aF8VPQ2 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Arid4aF8VPQ2 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Arid4aF8VPQ2 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Arid4aF8VPQ2 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Arid4aF8VPQ2 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Arid4aF8VPQ2 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Arid4aF8VPQ2 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Arid4aF8VPQ2 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Arid4aF8VPQ2 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Arid4aF8VPQ2 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Arid4aF8VPQ2 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15 ms