Protein–RNA interactions for Protein: F6YH22

Gm5218, 60S ribosomal protein L29, mousemouse

Predictions only

Length 154 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5218F6YH22 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gm5218F6YH22 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gm5218F6YH22 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gm5218F6YH22 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gm5218F6YH22 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gm5218F6YH22 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gm5218F6YH22 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gm5218F6YH22 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gm5218F6YH22 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gm5218F6YH22 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Gm5218F6YH22 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gm5218F6YH22 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gm5218F6YH22 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gm5218F6YH22 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gm5218F6YH22 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gm5218F6YH22 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gm5218F6YH22 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gm5218F6YH22 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gm5218F6YH22 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gm5218F6YH22 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gm5218F6YH22 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gm5218F6YH22 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gm5218F6YH22 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Gm5218F6YH22 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gm5218F6YH22 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gm5218F6YH22 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gm5218F6YH22 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gm5218F6YH22 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gm5218F6YH22 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gm5218F6YH22 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gm5218F6YH22 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gm5218F6YH22 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gm5218F6YH22 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gm5218F6YH22 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gm5218F6YH22 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gm5218F6YH22 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gm5218F6YH22 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gm5218F6YH22 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gm5218F6YH22 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gm5218F6YH22 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gm5218F6YH22 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gm5218F6YH22 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Gm5218F6YH22 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Gm5218F6YH22 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Gm5218F6YH22 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Gm5218F6YH22 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Gm5218F6YH22 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Gm5218F6YH22 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Gm5218F6YH22 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Gm5218F6YH22 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gm5218F6YH22 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gm5218F6YH22 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gm5218F6YH22 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gm5218F6YH22 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gm5218F6YH22 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gm5218F6YH22 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gm5218F6YH22 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gm5218F6YH22 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gm5218F6YH22 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Gm5218F6YH22 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Gm5218F6YH22 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gm5218F6YH22 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gm5218F6YH22 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gm5218F6YH22 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gm5218F6YH22 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gm5218F6YH22 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gm5218F6YH22 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gm5218F6YH22 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gm5218F6YH22 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gm5218F6YH22 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gm5218F6YH22 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gm5218F6YH22 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gm5218F6YH22 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gm5218F6YH22 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gm5218F6YH22 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gm5218F6YH22 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gm5218F6YH22 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gm5218F6YH22 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Gm5218F6YH22 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Gm5218F6YH22 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Gm5218F6YH22 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Gm5218F6YH22 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Gm5218F6YH22 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gm5218F6YH22 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Gm5218F6YH22 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gm5218F6YH22 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gm5218F6YH22 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gm5218F6YH22 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gm5218F6YH22 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gm5218F6YH22 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gm5218F6YH22 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Gm5218F6YH22 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gm5218F6YH22 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gm5218F6YH22 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gm5218F6YH22 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gm5218F6YH22 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gm5218F6YH22 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gm5218F6YH22 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gm5218F6YH22 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gm5218F6YH22 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.8 ms