Protein–RNA interactions for Protein: E9Q9Q6

Cdh18, Cadherin 18, mousemouse

Predictions only

Length 790 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdh18E9Q9Q6 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Cdh18E9Q9Q6 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Cdh18E9Q9Q6 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Cdh18E9Q9Q6 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Cdh18E9Q9Q6 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Cdh18E9Q9Q6 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Cdh18E9Q9Q6 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Cdh18E9Q9Q6 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Cdh18E9Q9Q6 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Cdh18E9Q9Q6 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Cdh18E9Q9Q6 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Cdh18E9Q9Q6 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Cdh18E9Q9Q6 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Cdh18E9Q9Q6 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Cdh18E9Q9Q6 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Cdh18E9Q9Q6 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Cdh18E9Q9Q6 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Cdh18E9Q9Q6 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Cdh18E9Q9Q6 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Cdh18E9Q9Q6 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Cdh18E9Q9Q6 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Cdh18E9Q9Q6 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Cdh18E9Q9Q6 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Cdh18E9Q9Q6 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cdh18E9Q9Q6 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cdh18E9Q9Q6 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cdh18E9Q9Q6 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cdh18E9Q9Q6 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Cdh18E9Q9Q6 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cdh18E9Q9Q6 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cdh18E9Q9Q6 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cdh18E9Q9Q6 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Cdh18E9Q9Q6 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Cdh18E9Q9Q6 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Cdh18E9Q9Q6 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Cdh18E9Q9Q6 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Cdh18E9Q9Q6 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Cdh18E9Q9Q6 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Cdh18E9Q9Q6 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Cdh18E9Q9Q6 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Cdh18E9Q9Q6 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Cdh18E9Q9Q6 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Cdh18E9Q9Q6 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cdh18E9Q9Q6 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cdh18E9Q9Q6 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cdh18E9Q9Q6 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cdh18E9Q9Q6 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Cdh18E9Q9Q6 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Cdh18E9Q9Q6 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Cdh18E9Q9Q6 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Cdh18E9Q9Q6 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Cdh18E9Q9Q6 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Cdh18E9Q9Q6 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Cdh18E9Q9Q6 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Cdh18E9Q9Q6 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Cdh18E9Q9Q6 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Cdh18E9Q9Q6 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Cdh18E9Q9Q6 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cdh18E9Q9Q6 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cdh18E9Q9Q6 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cdh18E9Q9Q6 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cdh18E9Q9Q6 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cdh18E9Q9Q6 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cdh18E9Q9Q6 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cdh18E9Q9Q6 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cdh18E9Q9Q6 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cdh18E9Q9Q6 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cdh18E9Q9Q6 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cdh18E9Q9Q6 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Cdh18E9Q9Q6 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cdh18E9Q9Q6 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cdh18E9Q9Q6 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cdh18E9Q9Q6 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cdh18E9Q9Q6 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Cdh18E9Q9Q6 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cdh18E9Q9Q6 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cdh18E9Q9Q6 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cdh18E9Q9Q6 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cdh18E9Q9Q6 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cdh18E9Q9Q6 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cdh18E9Q9Q6 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Cdh18E9Q9Q6 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Cdh18E9Q9Q6 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Cdh18E9Q9Q6 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Cdh18E9Q9Q6 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Cdh18E9Q9Q6 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cdh18E9Q9Q6 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cdh18E9Q9Q6 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cdh18E9Q9Q6 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cdh18E9Q9Q6 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cdh18E9Q9Q6 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cdh18E9Q9Q6 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cdh18E9Q9Q6 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cdh18E9Q9Q6 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cdh18E9Q9Q6 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cdh18E9Q9Q6 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cdh18E9Q9Q6 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cdh18E9Q9Q6 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cdh18E9Q9Q6 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cdh18E9Q9Q6 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.9 ms