Protein–RNA interactions for Protein: E9Q7L1

Urb2, URB2 ribosome biogenesis 2 homolog (S. cerevisiae), mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,524 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Urb2E9Q7L1 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.13■■■■□ 3.69
Urb2E9Q7L1 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.13■■■■□ 3.69
Urb2E9Q7L1 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC38.12■■■■□ 3.69
Urb2E9Q7L1 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.11■■■■□ 3.69
Urb2E9Q7L1 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC38.11■■■■□ 3.69
Urb2E9Q7L1 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.1■■■■□ 3.69
Urb2E9Q7L1 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC38.1■■■■□ 3.69
Urb2E9Q7L1 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC38.09■■■■□ 3.69
Urb2E9Q7L1 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC38.09■■■■□ 3.69
Urb2E9Q7L1 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.09■■■■□ 3.69
Urb2E9Q7L1 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.09■■■■□ 3.69
Urb2E9Q7L1 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.08■■■■□ 3.69
Urb2E9Q7L1 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.08■■■■□ 3.69
Urb2E9Q7L1 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.07■■■■□ 3.69
Urb2E9Q7L1 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.07■■■■□ 3.69
Urb2E9Q7L1 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC38.07■■■■□ 3.69
Urb2E9Q7L1 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC38.07■■■■□ 3.68
Urb2E9Q7L1 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC38.06■■■■□ 3.68
Urb2E9Q7L1 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC38.06■■■■□ 3.68
Urb2E9Q7L1 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.06■■■■□ 3.68
Urb2E9Q7L1 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.05■■■■□ 3.68
Urb2E9Q7L1 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC38.04■■■■□ 3.68
Urb2E9Q7L1 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.04■■■■□ 3.68
Urb2E9Q7L1 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.04■■■■□ 3.68
Urb2E9Q7L1 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.03■■■■□ 3.68
Urb2E9Q7L1 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC38.03■■■■□ 3.68
Urb2E9Q7L1 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.03■■■■□ 3.68
Urb2E9Q7L1 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.03■■■■□ 3.68
Urb2E9Q7L1 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.03■■■■□ 3.68
Urb2E9Q7L1 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.02■■■■□ 3.68
Urb2E9Q7L1 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC38.02■■■■□ 3.68
Urb2E9Q7L1 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC38.01■■■■□ 3.68
Urb2E9Q7L1 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC38.01■■■■□ 3.68
Urb2E9Q7L1 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.01■■■■□ 3.67
Urb2E9Q7L1 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.01■■■■□ 3.67
Urb2E9Q7L1 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38■■■■□ 3.67
Urb2E9Q7L1 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC38■■■■□ 3.67
Urb2E9Q7L1 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC37.99■■■■□ 3.67
Urb2E9Q7L1 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.98■■■■□ 3.67
Urb2E9Q7L1 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC37.97■■■■□ 3.67
Urb2E9Q7L1 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.97■■■■□ 3.67
Urb2E9Q7L1 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC37.97■■■■□ 3.67
Urb2E9Q7L1 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC37.97■■■■□ 3.67
Urb2E9Q7L1 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC37.97■■■■□ 3.67
Urb2E9Q7L1 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.97■■■■□ 3.67
Urb2E9Q7L1 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.96■■■■□ 3.67
Urb2E9Q7L1 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC37.96■■■■□ 3.67
Urb2E9Q7L1 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.96■■■■□ 3.67
Urb2E9Q7L1 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.96■■■■□ 3.67
Urb2E9Q7L1 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.96■■■■□ 3.67
Urb2E9Q7L1 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC37.95■■■■□ 3.67
Urb2E9Q7L1 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC37.95■■■■□ 3.67
Urb2E9Q7L1 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.94■■■■□ 3.66
Urb2E9Q7L1 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC37.94■■■■□ 3.66
Urb2E9Q7L1 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC37.93■■■■□ 3.66
Urb2E9Q7L1 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC37.93■■■■□ 3.66
Urb2E9Q7L1 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.92■■■■□ 3.66
Urb2E9Q7L1 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.92■■■■□ 3.66
Urb2E9Q7L1 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.92■■■■□ 3.66
Urb2E9Q7L1 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC37.92■■■■□ 3.66
Urb2E9Q7L1 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC37.91■■■■□ 3.66
Urb2E9Q7L1 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC37.88■■■■□ 3.65
Urb2E9Q7L1 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC37.88■■■■□ 3.65
Urb2E9Q7L1 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.87■■■■□ 3.65
Urb2E9Q7L1 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC37.87■■■■□ 3.65
Urb2E9Q7L1 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.86■■■■□ 3.65
Urb2E9Q7L1 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC37.85■■■■□ 3.65
Urb2E9Q7L1 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.85■■■■□ 3.65
Urb2E9Q7L1 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.85■■■■□ 3.65
Urb2E9Q7L1 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.84■■■■□ 3.65
Urb2E9Q7L1 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.84■■■■□ 3.65
Urb2E9Q7L1 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.84■■■■□ 3.65
Urb2E9Q7L1 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.83■■■■□ 3.65
Urb2E9Q7L1 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.83■■■■□ 3.65
Urb2E9Q7L1 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.83■■■■□ 3.65
Urb2E9Q7L1 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.82■■■■□ 3.65
Urb2E9Q7L1 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.82■■■■□ 3.64
Urb2E9Q7L1 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.82■■■■□ 3.64
Urb2E9Q7L1 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.82■■■■□ 3.64
Urb2E9Q7L1 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC37.82■■■■□ 3.64
Urb2E9Q7L1 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.82■■■■□ 3.64
Urb2E9Q7L1 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.8■■■■□ 3.64
Urb2E9Q7L1 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.8■■■■□ 3.64
Urb2E9Q7L1 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.79■■■■□ 3.64
Urb2E9Q7L1 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.79■■■■□ 3.64
Urb2E9Q7L1 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC37.79■■■■□ 3.64
Urb2E9Q7L1 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.78■■■■□ 3.64
Urb2E9Q7L1 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.76■■■■□ 3.64
Urb2E9Q7L1 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC37.76■■■■□ 3.64
Urb2E9Q7L1 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC37.76■■■■□ 3.64
Urb2E9Q7L1 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.75■■■■□ 3.63
Urb2E9Q7L1 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC37.74■■■■□ 3.63
Urb2E9Q7L1 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC37.74■■■■□ 3.63
Urb2E9Q7L1 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC37.73■■■■□ 3.63
Urb2E9Q7L1 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC37.73■■■■□ 3.63
Urb2E9Q7L1 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC37.73■■■■□ 3.63
Urb2E9Q7L1 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.72■■■■□ 3.63
Urb2E9Q7L1 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.71■■■■□ 3.63
Urb2E9Q7L1 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.71■■■■□ 3.63
Urb2E9Q7L1 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC37.7■■■■□ 3.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.8 ms