Protein–RNA interactions for Protein: E9Q548

Gm20518, Predicted gene 20518, mousemouse

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20518E9Q548 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Gm20518E9Q548 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
Gm20518E9Q548 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Gm20518E9Q548 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Gm20518E9Q548 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Gm20518E9Q548 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Gm20518E9Q548 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Gm20518E9Q548 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Gm20518E9Q548 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Gm20518E9Q548 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Gm20518E9Q548 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Gm20518E9Q548 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Gm20518E9Q548 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
Gm20518E9Q548 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Gm20518E9Q548 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Gm20518E9Q548 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Gm20518E9Q548 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Gm20518E9Q548 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Gm20518E9Q548 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Gm20518E9Q548 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Gm20518E9Q548 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Gm20518E9Q548 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Gm20518E9Q548 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Gm20518E9Q548 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Gm20518E9Q548 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Gm20518E9Q548 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Gm20518E9Q548 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Gm20518E9Q548 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
Gm20518E9Q548 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Gm20518E9Q548 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
Gm20518E9Q548 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Gm20518E9Q548 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Gm20518E9Q548 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Gm20518E9Q548 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Gm20518E9Q548 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Gm20518E9Q548 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Gm20518E9Q548 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
Gm20518E9Q548 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Gm20518E9Q548 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Gm20518E9Q548 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Gm20518E9Q548 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Gm20518E9Q548 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
Gm20518E9Q548 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Gm20518E9Q548 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.91
Gm20518E9Q548 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Gm20518E9Q548 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Gm20518E9Q548 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Gm20518E9Q548 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Gm20518E9Q548 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Gm20518E9Q548 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Gm20518E9Q548 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Gm20518E9Q548 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Gm20518E9Q548 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Gm20518E9Q548 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Gm20518E9Q548 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Gm20518E9Q548 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Gm20518E9Q548 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Gm20518E9Q548 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Gm20518E9Q548 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
Gm20518E9Q548 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Gm20518E9Q548 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Gm20518E9Q548 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Gm20518E9Q548 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Gm20518E9Q548 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Gm20518E9Q548 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Gm20518E9Q548 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
Gm20518E9Q548 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Gm20518E9Q548 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Gm20518E9Q548 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Gm20518E9Q548 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
Gm20518E9Q548 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Gm20518E9Q548 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Gm20518E9Q548 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Gm20518E9Q548 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Gm20518E9Q548 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Gm20518E9Q548 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC20.64■□□□□ 0.9
Gm20518E9Q548 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Gm20518E9Q548 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Gm20518E9Q548 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Gm20518E9Q548 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Gm20518E9Q548 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Gm20518E9Q548 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Gm20518E9Q548 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
Gm20518E9Q548 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Gm20518E9Q548 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Gm20518E9Q548 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Gm20518E9Q548 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Gm20518E9Q548 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Gm20518E9Q548 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Gm20518E9Q548 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Gm20518E9Q548 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Gm20518E9Q548 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Gm20518E9Q548 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Gm20518E9Q548 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Gm20518E9Q548 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Gm20518E9Q548 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Gm20518E9Q548 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Gm20518E9Q548 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Gm20518E9Q548 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Gm20518E9Q548 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.9 ms