Protein–RNA interactions for Protein: E9Q257

Gm8237, Predicted gene 8237, mousemouse

Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm8237E9Q257 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gm8237E9Q257 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gm8237E9Q257 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gm8237E9Q257 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gm8237E9Q257 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gm8237E9Q257 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gm8237E9Q257 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gm8237E9Q257 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gm8237E9Q257 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gm8237E9Q257 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gm8237E9Q257 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gm8237E9Q257 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Gm8237E9Q257 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Gm8237E9Q257 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Gm8237E9Q257 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Gm8237E9Q257 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Gm8237E9Q257 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Gm8237E9Q257 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Gm8237E9Q257 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Gm8237E9Q257 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Gm8237E9Q257 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Gm8237E9Q257 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Gm8237E9Q257 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gm8237E9Q257 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gm8237E9Q257 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gm8237E9Q257 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gm8237E9Q257 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gm8237E9Q257 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gm8237E9Q257 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gm8237E9Q257 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gm8237E9Q257 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gm8237E9Q257 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gm8237E9Q257 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gm8237E9Q257 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gm8237E9Q257 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gm8237E9Q257 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gm8237E9Q257 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gm8237E9Q257 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gm8237E9Q257 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gm8237E9Q257 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gm8237E9Q257 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gm8237E9Q257 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gm8237E9Q257 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gm8237E9Q257 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gm8237E9Q257 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gm8237E9Q257 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gm8237E9Q257 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gm8237E9Q257 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gm8237E9Q257 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gm8237E9Q257 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gm8237E9Q257 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gm8237E9Q257 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Gm8237E9Q257 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Gm8237E9Q257 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Gm8237E9Q257 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Gm8237E9Q257 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Gm8237E9Q257 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Gm8237E9Q257 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Gm8237E9Q257 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Gm8237E9Q257 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Gm8237E9Q257 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Gm8237E9Q257 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Gm8237E9Q257 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Gm8237E9Q257 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Gm8237E9Q257 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Gm8237E9Q257 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Gm8237E9Q257 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gm8237E9Q257 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Gm8237E9Q257 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gm8237E9Q257 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gm8237E9Q257 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gm8237E9Q257 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gm8237E9Q257 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gm8237E9Q257 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gm8237E9Q257 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Gm8237E9Q257 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Gm8237E9Q257 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Gm8237E9Q257 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Gm8237E9Q257 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
Gm8237E9Q257 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Gm8237E9Q257 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Gm8237E9Q257 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Gm8237E9Q257 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Gm8237E9Q257 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Gm8237E9Q257 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Gm8237E9Q257 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
Gm8237E9Q257 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Gm8237E9Q257 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Gm8237E9Q257 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Gm8237E9Q257 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gm8237E9Q257 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gm8237E9Q257 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gm8237E9Q257 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gm8237E9Q257 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gm8237E9Q257 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gm8237E9Q257 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gm8237E9Q257 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gm8237E9Q257 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gm8237E9Q257 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gm8237E9Q257 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8.9 ms