Protein–RNA interactions for Protein: E9PZQ0

Ryr1, Ryanodine receptor 1, mousemouse

Predictions only

Length 5,035 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ryr1E9PZQ0 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ryr1E9PZQ0 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ryr1E9PZQ0 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ryr1E9PZQ0 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ryr1E9PZQ0 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ryr1E9PZQ0 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ryr1E9PZQ0 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ryr1E9PZQ0 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ryr1E9PZQ0 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ryr1E9PZQ0 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ryr1E9PZQ0 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ryr1E9PZQ0 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ryr1E9PZQ0 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Ryr1E9PZQ0 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Ryr1E9PZQ0 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ryr1E9PZQ0 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ryr1E9PZQ0 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ryr1E9PZQ0 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ryr1E9PZQ0 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ryr1E9PZQ0 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ryr1E9PZQ0 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ryr1E9PZQ0 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Ryr1E9PZQ0 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ryr1E9PZQ0 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ryr1E9PZQ0 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ryr1E9PZQ0 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ryr1E9PZQ0 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ryr1E9PZQ0 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ryr1E9PZQ0 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ryr1E9PZQ0 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ryr1E9PZQ0 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ryr1E9PZQ0 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ryr1E9PZQ0 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ryr1E9PZQ0 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ryr1E9PZQ0 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ryr1E9PZQ0 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Ryr1E9PZQ0 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Ryr1E9PZQ0 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ryr1E9PZQ0 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ryr1E9PZQ0 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ryr1E9PZQ0 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ryr1E9PZQ0 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ryr1E9PZQ0 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ryr1E9PZQ0 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ryr1E9PZQ0 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ryr1E9PZQ0 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ryr1E9PZQ0 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ryr1E9PZQ0 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ryr1E9PZQ0 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ryr1E9PZQ0 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ryr1E9PZQ0 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ryr1E9PZQ0 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Ryr1E9PZQ0 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ryr1E9PZQ0 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ryr1E9PZQ0 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ryr1E9PZQ0 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ryr1E9PZQ0 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ryr1E9PZQ0 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Ryr1E9PZQ0 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ryr1E9PZQ0 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Ryr1E9PZQ0 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ryr1E9PZQ0 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ryr1E9PZQ0 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ryr1E9PZQ0 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ryr1E9PZQ0 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ryr1E9PZQ0 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ryr1E9PZQ0 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ryr1E9PZQ0 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ryr1E9PZQ0 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ryr1E9PZQ0 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ryr1E9PZQ0 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ryr1E9PZQ0 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ryr1E9PZQ0 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ryr1E9PZQ0 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ryr1E9PZQ0 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ryr1E9PZQ0 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ryr1E9PZQ0 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ryr1E9PZQ0 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ryr1E9PZQ0 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ryr1E9PZQ0 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ryr1E9PZQ0 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ryr1E9PZQ0 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ryr1E9PZQ0 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ryr1E9PZQ0 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ryr1E9PZQ0 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ryr1E9PZQ0 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ryr1E9PZQ0 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ryr1E9PZQ0 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ryr1E9PZQ0 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ryr1E9PZQ0 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ryr1E9PZQ0 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ryr1E9PZQ0 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ryr1E9PZQ0 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ryr1E9PZQ0 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ryr1E9PZQ0 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Ryr1E9PZQ0 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Ryr1E9PZQ0 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ryr1E9PZQ0 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ryr1E9PZQ0 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ryr1E9PZQ0 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.2 ms