Protein–RNA interactions for Protein: E0CYV9

1110002E22Rik, RIKEN cDNA 1110002E22 gene, mousemouse

Predictions only

Length 1,786 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1110002E22RikE0CYV9 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
1110002E22RikE0CYV9 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
1110002E22RikE0CYV9 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
1110002E22RikE0CYV9 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
1110002E22RikE0CYV9 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
1110002E22RikE0CYV9 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
1110002E22RikE0CYV9 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
1110002E22RikE0CYV9 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
1110002E22RikE0CYV9 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
1110002E22RikE0CYV9 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
1110002E22RikE0CYV9 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
1110002E22RikE0CYV9 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
1110002E22RikE0CYV9 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
1110002E22RikE0CYV9 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
1110002E22RikE0CYV9 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
1110002E22RikE0CYV9 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
1110002E22RikE0CYV9 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
1110002E22RikE0CYV9 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
1110002E22RikE0CYV9 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
1110002E22RikE0CYV9 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
1110002E22RikE0CYV9 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
1110002E22RikE0CYV9 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
1110002E22RikE0CYV9 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
1110002E22RikE0CYV9 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
1110002E22RikE0CYV9 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
1110002E22RikE0CYV9 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
1110002E22RikE0CYV9 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
1110002E22RikE0CYV9 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
1110002E22RikE0CYV9 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
1110002E22RikE0CYV9 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
1110002E22RikE0CYV9 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
1110002E22RikE0CYV9 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
1110002E22RikE0CYV9 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
1110002E22RikE0CYV9 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
1110002E22RikE0CYV9 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC24.64■■□□□ 1.53
1110002E22RikE0CYV9 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
1110002E22RikE0CYV9 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
1110002E22RikE0CYV9 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
1110002E22RikE0CYV9 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
1110002E22RikE0CYV9 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
1110002E22RikE0CYV9 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
1110002E22RikE0CYV9 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
1110002E22RikE0CYV9 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
1110002E22RikE0CYV9 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
1110002E22RikE0CYV9 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
1110002E22RikE0CYV9 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
1110002E22RikE0CYV9 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
1110002E22RikE0CYV9 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
1110002E22RikE0CYV9 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
1110002E22RikE0CYV9 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
1110002E22RikE0CYV9 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
1110002E22RikE0CYV9 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
1110002E22RikE0CYV9 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
1110002E22RikE0CYV9 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
1110002E22RikE0CYV9 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
1110002E22RikE0CYV9 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
1110002E22RikE0CYV9 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
1110002E22RikE0CYV9 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
1110002E22RikE0CYV9 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
1110002E22RikE0CYV9 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
1110002E22RikE0CYV9 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
1110002E22RikE0CYV9 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
1110002E22RikE0CYV9 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
1110002E22RikE0CYV9 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
1110002E22RikE0CYV9 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
1110002E22RikE0CYV9 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
1110002E22RikE0CYV9 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
1110002E22RikE0CYV9 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
1110002E22RikE0CYV9 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
1110002E22RikE0CYV9 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
1110002E22RikE0CYV9 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
1110002E22RikE0CYV9 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
1110002E22RikE0CYV9 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
1110002E22RikE0CYV9 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
1110002E22RikE0CYV9 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
1110002E22RikE0CYV9 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
1110002E22RikE0CYV9 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
1110002E22RikE0CYV9 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
1110002E22RikE0CYV9 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
1110002E22RikE0CYV9 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
1110002E22RikE0CYV9 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
1110002E22RikE0CYV9 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
1110002E22RikE0CYV9 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
1110002E22RikE0CYV9 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
1110002E22RikE0CYV9 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
1110002E22RikE0CYV9 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
1110002E22RikE0CYV9 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
1110002E22RikE0CYV9 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
1110002E22RikE0CYV9 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
1110002E22RikE0CYV9 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
1110002E22RikE0CYV9 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
1110002E22RikE0CYV9 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
1110002E22RikE0CYV9 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
1110002E22RikE0CYV9 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
1110002E22RikE0CYV9 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
1110002E22RikE0CYV9 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
1110002E22RikE0CYV9 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
1110002E22RikE0CYV9 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
1110002E22RikE0CYV9 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
1110002E22RikE0CYV9 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.9 ms