Protein–RNA interactions for Protein: D3Z2H9

Tpm3-rs7, Tropomyosin 3, related sequence 7, mousemouse

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpm3-rs7D3Z2H9 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Tpm3-rs7D3Z2H9 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Tpm3-rs7D3Z2H9 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
Tpm3-rs7D3Z2H9 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Tpm3-rs7D3Z2H9 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
Tpm3-rs7D3Z2H9 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Tpm3-rs7D3Z2H9 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Tpm3-rs7D3Z2H9 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Tpm3-rs7D3Z2H9 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Tpm3-rs7D3Z2H9 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
Tpm3-rs7D3Z2H9 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Tpm3-rs7D3Z2H9 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Tpm3-rs7D3Z2H9 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
Tpm3-rs7D3Z2H9 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Tpm3-rs7D3Z2H9 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Tpm3-rs7D3Z2H9 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
Tpm3-rs7D3Z2H9 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Tpm3-rs7D3Z2H9 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Tpm3-rs7D3Z2H9 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Tpm3-rs7D3Z2H9 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Tpm3-rs7D3Z2H9 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Tpm3-rs7D3Z2H9 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Tpm3-rs7D3Z2H9 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Tpm3-rs7D3Z2H9 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Tpm3-rs7D3Z2H9 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Tpm3-rs7D3Z2H9 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Tpm3-rs7D3Z2H9 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Tpm3-rs7D3Z2H9 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Tpm3-rs7D3Z2H9 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Tpm3-rs7D3Z2H9 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Tpm3-rs7D3Z2H9 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Tpm3-rs7D3Z2H9 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Tpm3-rs7D3Z2H9 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Tpm3-rs7D3Z2H9 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Tpm3-rs7D3Z2H9 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Tpm3-rs7D3Z2H9 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Tpm3-rs7D3Z2H9 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Tpm3-rs7D3Z2H9 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Tpm3-rs7D3Z2H9 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Tpm3-rs7D3Z2H9 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Tpm3-rs7D3Z2H9 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Tpm3-rs7D3Z2H9 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Tpm3-rs7D3Z2H9 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Tpm3-rs7D3Z2H9 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Tpm3-rs7D3Z2H9 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
Tpm3-rs7D3Z2H9 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
Tpm3-rs7D3Z2H9 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Tpm3-rs7D3Z2H9 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Tpm3-rs7D3Z2H9 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Tpm3-rs7D3Z2H9 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Tpm3-rs7D3Z2H9 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Tpm3-rs7D3Z2H9 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.68
Tpm3-rs7D3Z2H9 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Tpm3-rs7D3Z2H9 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Tpm3-rs7D3Z2H9 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
Tpm3-rs7D3Z2H9 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Tpm3-rs7D3Z2H9 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Tpm3-rs7D3Z2H9 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Tpm3-rs7D3Z2H9 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Tpm3-rs7D3Z2H9 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Tpm3-rs7D3Z2H9 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.4 ms