Protein–RNA interactions for Protein: D3YZZ5

Tmed7, Transmembrane p24-trafficking protein 7, mousemouse

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmed7D3YZZ5 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Tmed7D3YZZ5 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Tmed7D3YZZ5 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tmed7D3YZZ5 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tmed7D3YZZ5 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tmed7D3YZZ5 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tmed7D3YZZ5 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tmed7D3YZZ5 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tmed7D3YZZ5 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Tmed7D3YZZ5 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Tmed7D3YZZ5 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Tmed7D3YZZ5 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tmed7D3YZZ5 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tmed7D3YZZ5 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tmed7D3YZZ5 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tmed7D3YZZ5 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tmed7D3YZZ5 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tmed7D3YZZ5 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tmed7D3YZZ5 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tmed7D3YZZ5 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tmed7D3YZZ5 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tmed7D3YZZ5 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tmed7D3YZZ5 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Tmed7D3YZZ5 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Tmed7D3YZZ5 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tmed7D3YZZ5 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tmed7D3YZZ5 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tmed7D3YZZ5 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tmed7D3YZZ5 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tmed7D3YZZ5 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tmed7D3YZZ5 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tmed7D3YZZ5 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Tmed7D3YZZ5 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tmed7D3YZZ5 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tmed7D3YZZ5 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tmed7D3YZZ5 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tmed7D3YZZ5 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Tmed7D3YZZ5 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Tmed7D3YZZ5 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Tmed7D3YZZ5 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Tmed7D3YZZ5 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Tmed7D3YZZ5 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Tmed7D3YZZ5 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Tmed7D3YZZ5 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Tmed7D3YZZ5 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
Tmed7D3YZZ5 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Tmed7D3YZZ5 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Tmed7D3YZZ5 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Tmed7D3YZZ5 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Tmed7D3YZZ5 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Tmed7D3YZZ5 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Tmed7D3YZZ5 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Tmed7D3YZZ5 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Tmed7D3YZZ5 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
Tmed7D3YZZ5 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Tmed7D3YZZ5 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Tmed7D3YZZ5 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tmed7D3YZZ5 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tmed7D3YZZ5 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Tmed7D3YZZ5 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Tmed7D3YZZ5 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Tmed7D3YZZ5 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Tmed7D3YZZ5 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
Tmed7D3YZZ5 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Tmed7D3YZZ5 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
Tmed7D3YZZ5 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Tmed7D3YZZ5 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Tmed7D3YZZ5 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Tmed7D3YZZ5 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Tmed7D3YZZ5 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Tmed7D3YZZ5 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Tmed7D3YZZ5 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tmed7D3YZZ5 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tmed7D3YZZ5 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tmed7D3YZZ5 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tmed7D3YZZ5 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tmed7D3YZZ5 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tmed7D3YZZ5 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tmed7D3YZZ5 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tmed7D3YZZ5 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Tmed7D3YZZ5 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Tmed7D3YZZ5 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Tmed7D3YZZ5 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Tmed7D3YZZ5 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Tmed7D3YZZ5 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Tmed7D3YZZ5 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Tmed7D3YZZ5 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Tmed7D3YZZ5 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Tmed7D3YZZ5 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Tmed7D3YZZ5 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Tmed7D3YZZ5 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Tmed7D3YZZ5 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Tmed7D3YZZ5 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Tmed7D3YZZ5 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Tmed7D3YZZ5 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Tmed7D3YZZ5 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Tmed7D3YZZ5 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Tmed7D3YZZ5 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Tmed7D3YZZ5 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Tmed7D3YZZ5 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.2 ms