Protein–RNA interactions for Protein: D3YYZ1

Ldlrad1, Low density lipoprotein receptor class A domain-containing 1, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ldlrad1D3YYZ1 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Ldlrad1D3YYZ1 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Ldlrad1D3YYZ1 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Ldlrad1D3YYZ1 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Ldlrad1D3YYZ1 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Ldlrad1D3YYZ1 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Ldlrad1D3YYZ1 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Ldlrad1D3YYZ1 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Ldlrad1D3YYZ1 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Ldlrad1D3YYZ1 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Ldlrad1D3YYZ1 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Ldlrad1D3YYZ1 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Ldlrad1D3YYZ1 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Ldlrad1D3YYZ1 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
Ldlrad1D3YYZ1 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Ldlrad1D3YYZ1 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Ldlrad1D3YYZ1 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Ldlrad1D3YYZ1 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Ldlrad1D3YYZ1 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Ldlrad1D3YYZ1 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Ldlrad1D3YYZ1 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Ldlrad1D3YYZ1 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Ldlrad1D3YYZ1 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Ldlrad1D3YYZ1 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Ldlrad1D3YYZ1 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
Ldlrad1D3YYZ1 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
Ldlrad1D3YYZ1 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Ldlrad1D3YYZ1 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Ldlrad1D3YYZ1 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Ldlrad1D3YYZ1 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Ldlrad1D3YYZ1 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Ldlrad1D3YYZ1 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Ldlrad1D3YYZ1 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Ldlrad1D3YYZ1 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
Ldlrad1D3YYZ1 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Ldlrad1D3YYZ1 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.68
Ldlrad1D3YYZ1 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Ldlrad1D3YYZ1 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Ldlrad1D3YYZ1 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Ldlrad1D3YYZ1 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Ldlrad1D3YYZ1 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Ldlrad1D3YYZ1 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Ldlrad1D3YYZ1 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Ldlrad1D3YYZ1 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Ldlrad1D3YYZ1 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Ldlrad1D3YYZ1 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Ldlrad1D3YYZ1 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Ldlrad1D3YYZ1 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Ldlrad1D3YYZ1 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Ldlrad1D3YYZ1 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Ldlrad1D3YYZ1 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Ldlrad1D3YYZ1 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Ldlrad1D3YYZ1 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Ldlrad1D3YYZ1 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
Ldlrad1D3YYZ1 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Ldlrad1D3YYZ1 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Ldlrad1D3YYZ1 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Ldlrad1D3YYZ1 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
Ldlrad1D3YYZ1 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Ldlrad1D3YYZ1 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Ldlrad1D3YYZ1 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Ldlrad1D3YYZ1 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Ldlrad1D3YYZ1 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Ldlrad1D3YYZ1 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Ldlrad1D3YYZ1 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Ldlrad1D3YYZ1 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Ldlrad1D3YYZ1 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Ldlrad1D3YYZ1 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ldlrad1D3YYZ1 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ldlrad1D3YYZ1 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ldlrad1D3YYZ1 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
Ldlrad1D3YYZ1 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Ldlrad1D3YYZ1 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Ldlrad1D3YYZ1 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Ldlrad1D3YYZ1 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Ldlrad1D3YYZ1 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Ldlrad1D3YYZ1 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Ldlrad1D3YYZ1 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Ldlrad1D3YYZ1 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Ldlrad1D3YYZ1 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Ldlrad1D3YYZ1 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Ldlrad1D3YYZ1 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
Ldlrad1D3YYZ1 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Ldlrad1D3YYZ1 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Ldlrad1D3YYZ1 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Ldlrad1D3YYZ1 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
Ldlrad1D3YYZ1 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Ldlrad1D3YYZ1 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Ldlrad1D3YYZ1 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Ldlrad1D3YYZ1 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Ldlrad1D3YYZ1 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Ldlrad1D3YYZ1 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Ldlrad1D3YYZ1 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Ldlrad1D3YYZ1 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Ldlrad1D3YYZ1 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Ldlrad1D3YYZ1 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Ldlrad1D3YYZ1 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
Ldlrad1D3YYZ1 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Ldlrad1D3YYZ1 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ldlrad1D3YYZ1 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.2 ms