Protein–RNA interactions for Protein: B8JJD6

Fance, Fanconi anemia, complementation group E, mousemouse

Predictions only

Length 213 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FanceB8JJD6 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
FanceB8JJD6 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
FanceB8JJD6 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
FanceB8JJD6 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
FanceB8JJD6 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
FanceB8JJD6 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
FanceB8JJD6 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
FanceB8JJD6 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
FanceB8JJD6 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
FanceB8JJD6 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
FanceB8JJD6 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
FanceB8JJD6 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
FanceB8JJD6 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
FanceB8JJD6 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
FanceB8JJD6 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
FanceB8JJD6 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
FanceB8JJD6 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
FanceB8JJD6 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
FanceB8JJD6 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
FanceB8JJD6 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
FanceB8JJD6 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
FanceB8JJD6 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
FanceB8JJD6 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
FanceB8JJD6 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
FanceB8JJD6 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
FanceB8JJD6 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
FanceB8JJD6 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
FanceB8JJD6 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
FanceB8JJD6 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
FanceB8JJD6 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
FanceB8JJD6 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
FanceB8JJD6 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
FanceB8JJD6 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
FanceB8JJD6 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
FanceB8JJD6 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
FanceB8JJD6 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.14
FanceB8JJD6 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
FanceB8JJD6 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
FanceB8JJD6 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
FanceB8JJD6 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
FanceB8JJD6 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FanceB8JJD6 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FanceB8JJD6 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
FanceB8JJD6 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FanceB8JJD6 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
FanceB8JJD6 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FanceB8JJD6 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FanceB8JJD6 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FanceB8JJD6 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FanceB8JJD6 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FanceB8JJD6 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
FanceB8JJD6 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
FanceB8JJD6 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FanceB8JJD6 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FanceB8JJD6 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FanceB8JJD6 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
FanceB8JJD6 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
FanceB8JJD6 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
FanceB8JJD6 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
FanceB8JJD6 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
FanceB8JJD6 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FanceB8JJD6 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FanceB8JJD6 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FanceB8JJD6 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FanceB8JJD6 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
FanceB8JJD6 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
FanceB8JJD6 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
FanceB8JJD6 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
FanceB8JJD6 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
FanceB8JJD6 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
FanceB8JJD6 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
FanceB8JJD6 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
FanceB8JJD6 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
FanceB8JJD6 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FanceB8JJD6 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FanceB8JJD6 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
FanceB8JJD6 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FanceB8JJD6 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FanceB8JJD6 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
FanceB8JJD6 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
FanceB8JJD6 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
FanceB8JJD6 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
FanceB8JJD6 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
FanceB8JJD6 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
FanceB8JJD6 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
FanceB8JJD6 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
FanceB8JJD6 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
FanceB8JJD6 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
FanceB8JJD6 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
FanceB8JJD6 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
FanceB8JJD6 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
FanceB8JJD6 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
FanceB8JJD6 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
FanceB8JJD6 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
FanceB8JJD6 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
FanceB8JJD6 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
FanceB8JJD6 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
FanceB8JJD6 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
FanceB8JJD6 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
FanceB8JJD6 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
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