Protein–RNA interactions for Protein: B7XG49

Fam71a, Family with sequence similarity 71, member A, mousemouse

Predictions only

Length 585 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam71aB7XG49 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Fam71aB7XG49 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Fam71aB7XG49 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Fam71aB7XG49 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Fam71aB7XG49 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Fam71aB7XG49 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Fam71aB7XG49 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Fam71aB7XG49 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Fam71aB7XG49 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Fam71aB7XG49 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Fam71aB7XG49 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Fam71aB7XG49 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Fam71aB7XG49 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Fam71aB7XG49 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Fam71aB7XG49 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Fam71aB7XG49 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Fam71aB7XG49 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Fam71aB7XG49 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Fam71aB7XG49 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Fam71aB7XG49 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Fam71aB7XG49 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Fam71aB7XG49 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Fam71aB7XG49 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Fam71aB7XG49 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Fam71aB7XG49 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Fam71aB7XG49 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Fam71aB7XG49 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Fam71aB7XG49 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Fam71aB7XG49 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Fam71aB7XG49 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Fam71aB7XG49 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Fam71aB7XG49 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Fam71aB7XG49 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Fam71aB7XG49 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
Fam71aB7XG49 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Fam71aB7XG49 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Fam71aB7XG49 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Fam71aB7XG49 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Fam71aB7XG49 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Fam71aB7XG49 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Fam71aB7XG49 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Fam71aB7XG49 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Fam71aB7XG49 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Fam71aB7XG49 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Fam71aB7XG49 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Fam71aB7XG49 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Fam71aB7XG49 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Fam71aB7XG49 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Fam71aB7XG49 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Fam71aB7XG49 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Fam71aB7XG49 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Fam71aB7XG49 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Fam71aB7XG49 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Fam71aB7XG49 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Fam71aB7XG49 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Fam71aB7XG49 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Fam71aB7XG49 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Fam71aB7XG49 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Fam71aB7XG49 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Fam71aB7XG49 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Fam71aB7XG49 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Fam71aB7XG49 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Fam71aB7XG49 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Fam71aB7XG49 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Fam71aB7XG49 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Fam71aB7XG49 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Fam71aB7XG49 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Fam71aB7XG49 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Fam71aB7XG49 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Fam71aB7XG49 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Fam71aB7XG49 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Fam71aB7XG49 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
Fam71aB7XG49 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Fam71aB7XG49 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Fam71aB7XG49 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Fam71aB7XG49 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Fam71aB7XG49 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
Fam71aB7XG49 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Fam71aB7XG49 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
Fam71aB7XG49 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Fam71aB7XG49 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Fam71aB7XG49 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Fam71aB7XG49 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Fam71aB7XG49 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Fam71aB7XG49 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Fam71aB7XG49 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Fam71aB7XG49 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Fam71aB7XG49 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Fam71aB7XG49 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Fam71aB7XG49 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Fam71aB7XG49 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Fam71aB7XG49 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Fam71aB7XG49 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Fam71aB7XG49 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Fam71aB7XG49 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Fam71aB7XG49 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Fam71aB7XG49 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Fam71aB7XG49 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Fam71aB7XG49 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Fam71aB7XG49 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.9 ms