Protein–RNA interactions for Protein: B2RUJ5

Apba1, Amyloid-beta A4 precursor protein-binding family A member 1, mousemouse

Predictions only

Length 842 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apba1B2RUJ5 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Apba1B2RUJ5 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Apba1B2RUJ5 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Apba1B2RUJ5 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Apba1B2RUJ5 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Apba1B2RUJ5 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Apba1B2RUJ5 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Apba1B2RUJ5 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Apba1B2RUJ5 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Apba1B2RUJ5 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Apba1B2RUJ5 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Apba1B2RUJ5 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Apba1B2RUJ5 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Apba1B2RUJ5 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Apba1B2RUJ5 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Apba1B2RUJ5 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Apba1B2RUJ5 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Apba1B2RUJ5 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Apba1B2RUJ5 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Apba1B2RUJ5 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Apba1B2RUJ5 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Apba1B2RUJ5 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Apba1B2RUJ5 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Apba1B2RUJ5 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Apba1B2RUJ5 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Apba1B2RUJ5 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Apba1B2RUJ5 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Apba1B2RUJ5 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Apba1B2RUJ5 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Apba1B2RUJ5 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Apba1B2RUJ5 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Apba1B2RUJ5 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Apba1B2RUJ5 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Apba1B2RUJ5 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Apba1B2RUJ5 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Apba1B2RUJ5 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Apba1B2RUJ5 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Apba1B2RUJ5 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Apba1B2RUJ5 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Apba1B2RUJ5 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Apba1B2RUJ5 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Apba1B2RUJ5 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Apba1B2RUJ5 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Apba1B2RUJ5 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Apba1B2RUJ5 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Apba1B2RUJ5 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Apba1B2RUJ5 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Apba1B2RUJ5 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Apba1B2RUJ5 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Apba1B2RUJ5 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Apba1B2RUJ5 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Apba1B2RUJ5 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Apba1B2RUJ5 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Apba1B2RUJ5 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Apba1B2RUJ5 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Apba1B2RUJ5 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Apba1B2RUJ5 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Apba1B2RUJ5 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Apba1B2RUJ5 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Apba1B2RUJ5 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Apba1B2RUJ5 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Apba1B2RUJ5 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Apba1B2RUJ5 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Apba1B2RUJ5 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Apba1B2RUJ5 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Apba1B2RUJ5 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Apba1B2RUJ5 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Apba1B2RUJ5 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Apba1B2RUJ5 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Apba1B2RUJ5 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Apba1B2RUJ5 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Apba1B2RUJ5 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Apba1B2RUJ5 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Apba1B2RUJ5 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Apba1B2RUJ5 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Apba1B2RUJ5 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Apba1B2RUJ5 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Apba1B2RUJ5 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Apba1B2RUJ5 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Apba1B2RUJ5 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Apba1B2RUJ5 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Apba1B2RUJ5 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Apba1B2RUJ5 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Apba1B2RUJ5 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Apba1B2RUJ5 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Apba1B2RUJ5 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Apba1B2RUJ5 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Apba1B2RUJ5 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Apba1B2RUJ5 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Apba1B2RUJ5 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Apba1B2RUJ5 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Apba1B2RUJ5 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Apba1B2RUJ5 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Apba1B2RUJ5 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Apba1B2RUJ5 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Apba1B2RUJ5 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Apba1B2RUJ5 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Apba1B2RUJ5 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Apba1B2RUJ5 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Apba1B2RUJ5 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 122.7 ms