Protein–RNA interactions for Protein: B2RU80

Ptprb, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,998 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprbB2RU80 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PtprbB2RU80 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
PtprbB2RU80 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
PtprbB2RU80 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
PtprbB2RU80 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC20.75■□□□□ 0.91
PtprbB2RU80 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
PtprbB2RU80 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
PtprbB2RU80 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
PtprbB2RU80 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
PtprbB2RU80 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
PtprbB2RU80 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
PtprbB2RU80 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
PtprbB2RU80 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
PtprbB2RU80 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
PtprbB2RU80 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
PtprbB2RU80 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
PtprbB2RU80 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
PtprbB2RU80 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
PtprbB2RU80 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
PtprbB2RU80 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
PtprbB2RU80 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
PtprbB2RU80 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
PtprbB2RU80 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
PtprbB2RU80 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
PtprbB2RU80 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC20.72■□□□□ 0.91
PtprbB2RU80 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
PtprbB2RU80 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
PtprbB2RU80 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC20.71■□□□□ 0.91
PtprbB2RU80 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
PtprbB2RU80 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
PtprbB2RU80 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
PtprbB2RU80 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
PtprbB2RU80 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
PtprbB2RU80 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
PtprbB2RU80 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
PtprbB2RU80 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
PtprbB2RU80 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
PtprbB2RU80 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
PtprbB2RU80 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
PtprbB2RU80 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
PtprbB2RU80 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
PtprbB2RU80 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
PtprbB2RU80 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
PtprbB2RU80 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
PtprbB2RU80 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
PtprbB2RU80 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC20.68■□□□□ 0.9
PtprbB2RU80 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
PtprbB2RU80 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
PtprbB2RU80 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
PtprbB2RU80 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
PtprbB2RU80 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
PtprbB2RU80 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
PtprbB2RU80 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
PtprbB2RU80 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
PtprbB2RU80 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
PtprbB2RU80 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
PtprbB2RU80 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
PtprbB2RU80 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
PtprbB2RU80 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
PtprbB2RU80 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
PtprbB2RU80 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
PtprbB2RU80 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
PtprbB2RU80 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
PtprbB2RU80 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PtprbB2RU80 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PtprbB2RU80 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PtprbB2RU80 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PtprbB2RU80 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PtprbB2RU80 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PtprbB2RU80 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PtprbB2RU80 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
PtprbB2RU80 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PtprbB2RU80 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PtprbB2RU80 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PtprbB2RU80 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PtprbB2RU80 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PtprbB2RU80 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PtprbB2RU80 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.89
PtprbB2RU80 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
PtprbB2RU80 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.88
PtprbB2RU80 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
PtprbB2RU80 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PtprbB2RU80 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PtprbB2RU80 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PtprbB2RU80 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PtprbB2RU80 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
PtprbB2RU80 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
PtprbB2RU80 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
PtprbB2RU80 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PtprbB2RU80 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PtprbB2RU80 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PtprbB2RU80 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PtprbB2RU80 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PtprbB2RU80 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
PtprbB2RU80 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PtprbB2RU80 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PtprbB2RU80 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PtprbB2RU80 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PtprbB2RU80 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PtprbB2RU80 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.5 ms