Protein–RNA interactions for Protein: B1AWZ3

Nipsnap3a, Nipsnap homolog 3A, mousemouse

Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nipsnap3aB1AWZ3 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Nipsnap3aB1AWZ3 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Nipsnap3aB1AWZ3 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Nipsnap3aB1AWZ3 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Nipsnap3aB1AWZ3 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Nipsnap3aB1AWZ3 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Nipsnap3aB1AWZ3 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Nipsnap3aB1AWZ3 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Nipsnap3aB1AWZ3 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Nipsnap3aB1AWZ3 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Nipsnap3aB1AWZ3 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Nipsnap3aB1AWZ3 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Nipsnap3aB1AWZ3 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Nipsnap3aB1AWZ3 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Nipsnap3aB1AWZ3 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Nipsnap3aB1AWZ3 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Nipsnap3aB1AWZ3 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Nipsnap3aB1AWZ3 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Nipsnap3aB1AWZ3 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Nipsnap3aB1AWZ3 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Nipsnap3aB1AWZ3 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Nipsnap3aB1AWZ3 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Nipsnap3aB1AWZ3 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Nipsnap3aB1AWZ3 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Nipsnap3aB1AWZ3 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Nipsnap3aB1AWZ3 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Nipsnap3aB1AWZ3 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Nipsnap3aB1AWZ3 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Nipsnap3aB1AWZ3 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Nipsnap3aB1AWZ3 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Nipsnap3aB1AWZ3 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Nipsnap3aB1AWZ3 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Nipsnap3aB1AWZ3 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Nipsnap3aB1AWZ3 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Nipsnap3aB1AWZ3 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Nipsnap3aB1AWZ3 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Nipsnap3aB1AWZ3 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Nipsnap3aB1AWZ3 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Nipsnap3aB1AWZ3 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Nipsnap3aB1AWZ3 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Nipsnap3aB1AWZ3 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Nipsnap3aB1AWZ3 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Nipsnap3aB1AWZ3 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Nipsnap3aB1AWZ3 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Nipsnap3aB1AWZ3 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Nipsnap3aB1AWZ3 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Nipsnap3aB1AWZ3 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Nipsnap3aB1AWZ3 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Nipsnap3aB1AWZ3 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Nipsnap3aB1AWZ3 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Nipsnap3aB1AWZ3 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Nipsnap3aB1AWZ3 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Nipsnap3aB1AWZ3 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Nipsnap3aB1AWZ3 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Nipsnap3aB1AWZ3 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Nipsnap3aB1AWZ3 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Nipsnap3aB1AWZ3 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Nipsnap3aB1AWZ3 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Nipsnap3aB1AWZ3 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Nipsnap3aB1AWZ3 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Nipsnap3aB1AWZ3 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Nipsnap3aB1AWZ3 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Nipsnap3aB1AWZ3 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Nipsnap3aB1AWZ3 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Nipsnap3aB1AWZ3 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Nipsnap3aB1AWZ3 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Nipsnap3aB1AWZ3 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Nipsnap3aB1AWZ3 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Nipsnap3aB1AWZ3 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Nipsnap3aB1AWZ3 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Nipsnap3aB1AWZ3 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Nipsnap3aB1AWZ3 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Nipsnap3aB1AWZ3 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Nipsnap3aB1AWZ3 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Nipsnap3aB1AWZ3 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Nipsnap3aB1AWZ3 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Nipsnap3aB1AWZ3 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Nipsnap3aB1AWZ3 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Nipsnap3aB1AWZ3 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Nipsnap3aB1AWZ3 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Nipsnap3aB1AWZ3 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Nipsnap3aB1AWZ3 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Nipsnap3aB1AWZ3 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Nipsnap3aB1AWZ3 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Nipsnap3aB1AWZ3 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Nipsnap3aB1AWZ3 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Nipsnap3aB1AWZ3 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Nipsnap3aB1AWZ3 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Nipsnap3aB1AWZ3 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.4 ms