Protein–RNA interactions for Protein: B1AVK5

Col4a6, Collagen, type IV, alpha 6, mousemouse

Predictions only

Length 1,691 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col4a6B1AVK5 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Col4a6B1AVK5 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Col4a6B1AVK5 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Col4a6B1AVK5 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Col4a6B1AVK5 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
Col4a6B1AVK5 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Col4a6B1AVK5 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Col4a6B1AVK5 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Col4a6B1AVK5 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Col4a6B1AVK5 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Col4a6B1AVK5 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Col4a6B1AVK5 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Col4a6B1AVK5 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Col4a6B1AVK5 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Col4a6B1AVK5 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Col4a6B1AVK5 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Col4a6B1AVK5 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Col4a6B1AVK5 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Col4a6B1AVK5 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Col4a6B1AVK5 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Col4a6B1AVK5 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Col4a6B1AVK5 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Col4a6B1AVK5 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Col4a6B1AVK5 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Col4a6B1AVK5 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Col4a6B1AVK5 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Col4a6B1AVK5 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Col4a6B1AVK5 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Col4a6B1AVK5 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Col4a6B1AVK5 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Col4a6B1AVK5 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Col4a6B1AVK5 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Col4a6B1AVK5 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Col4a6B1AVK5 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Col4a6B1AVK5 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Col4a6B1AVK5 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Col4a6B1AVK5 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Col4a6B1AVK5 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Col4a6B1AVK5 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Col4a6B1AVK5 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Col4a6B1AVK5 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Col4a6B1AVK5 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Col4a6B1AVK5 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Col4a6B1AVK5 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Col4a6B1AVK5 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Col4a6B1AVK5 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Col4a6B1AVK5 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Col4a6B1AVK5 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Col4a6B1AVK5 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Col4a6B1AVK5 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Col4a6B1AVK5 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Col4a6B1AVK5 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Col4a6B1AVK5 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Col4a6B1AVK5 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Col4a6B1AVK5 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Col4a6B1AVK5 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Col4a6B1AVK5 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Col4a6B1AVK5 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Col4a6B1AVK5 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Col4a6B1AVK5 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Col4a6B1AVK5 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Col4a6B1AVK5 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Col4a6B1AVK5 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Col4a6B1AVK5 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Col4a6B1AVK5 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Col4a6B1AVK5 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Col4a6B1AVK5 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Col4a6B1AVK5 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Col4a6B1AVK5 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Col4a6B1AVK5 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Col4a6B1AVK5 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Col4a6B1AVK5 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Col4a6B1AVK5 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Col4a6B1AVK5 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Col4a6B1AVK5 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Col4a6B1AVK5 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Col4a6B1AVK5 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Col4a6B1AVK5 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Col4a6B1AVK5 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Col4a6B1AVK5 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Col4a6B1AVK5 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Col4a6B1AVK5 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Col4a6B1AVK5 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Col4a6B1AVK5 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Col4a6B1AVK5 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Col4a6B1AVK5 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Col4a6B1AVK5 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Col4a6B1AVK5 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Col4a6B1AVK5 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Col4a6B1AVK5 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Col4a6B1AVK5 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Col4a6B1AVK5 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Col4a6B1AVK5 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Col4a6B1AVK5 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Col4a6B1AVK5 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Col4a6B1AVK5 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Col4a6B1AVK5 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Col4a6B1AVK5 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Col4a6B1AVK5 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Col4a6B1AVK5 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.9 ms