Protein–RNA interactions for Protein: B1AV28

Gm14862, Predicted gene 14862, mousemouse

Predictions only

Length 81 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm14862B1AV28 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gm14862B1AV28 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gm14862B1AV28 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gm14862B1AV28 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gm14862B1AV28 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gm14862B1AV28 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gm14862B1AV28 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gm14862B1AV28 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gm14862B1AV28 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gm14862B1AV28 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gm14862B1AV28 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gm14862B1AV28 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gm14862B1AV28 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gm14862B1AV28 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Gm14862B1AV28 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Gm14862B1AV28 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Gm14862B1AV28 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gm14862B1AV28 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gm14862B1AV28 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gm14862B1AV28 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gm14862B1AV28 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gm14862B1AV28 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gm14862B1AV28 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gm14862B1AV28 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gm14862B1AV28 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gm14862B1AV28 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gm14862B1AV28 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gm14862B1AV28 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gm14862B1AV28 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gm14862B1AV28 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gm14862B1AV28 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gm14862B1AV28 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gm14862B1AV28 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gm14862B1AV28 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gm14862B1AV28 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gm14862B1AV28 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gm14862B1AV28 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gm14862B1AV28 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gm14862B1AV28 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gm14862B1AV28 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gm14862B1AV28 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gm14862B1AV28 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gm14862B1AV28 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Gm14862B1AV28 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Gm14862B1AV28 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Gm14862B1AV28 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Gm14862B1AV28 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Gm14862B1AV28 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gm14862B1AV28 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gm14862B1AV28 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gm14862B1AV28 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gm14862B1AV28 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gm14862B1AV28 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gm14862B1AV28 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Gm14862B1AV28 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Gm14862B1AV28 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Gm14862B1AV28 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
Gm14862B1AV28 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Gm14862B1AV28 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gm14862B1AV28 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gm14862B1AV28 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gm14862B1AV28 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gm14862B1AV28 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gm14862B1AV28 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gm14862B1AV28 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gm14862B1AV28 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gm14862B1AV28 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gm14862B1AV28 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gm14862B1AV28 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gm14862B1AV28 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gm14862B1AV28 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gm14862B1AV28 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gm14862B1AV28 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gm14862B1AV28 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gm14862B1AV28 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Gm14862B1AV28 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Gm14862B1AV28 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Gm14862B1AV28 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Gm14862B1AV28 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gm14862B1AV28 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gm14862B1AV28 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gm14862B1AV28 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Gm14862B1AV28 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Gm14862B1AV28 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Gm14862B1AV28 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Gm14862B1AV28 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Gm14862B1AV28 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Gm14862B1AV28 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Gm14862B1AV28 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Gm14862B1AV28 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Gm14862B1AV28 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Gm14862B1AV28 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Gm14862B1AV28 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Gm14862B1AV28 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Gm14862B1AV28 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Gm14862B1AV28 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Gm14862B1AV28 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Gm14862B1AV28 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Gm14862B1AV28 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Gm14862B1AV28 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms