Protein–RNA interactions for Protein: A9JSM3

Tmem238, Transmembrane protein 238, mousemouse

Predictions only

Length 176 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem238A9JSM3 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tmem238A9JSM3 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tmem238A9JSM3 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tmem238A9JSM3 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tmem238A9JSM3 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tmem238A9JSM3 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tmem238A9JSM3 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tmem238A9JSM3 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tmem238A9JSM3 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tmem238A9JSM3 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tmem238A9JSM3 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tmem238A9JSM3 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tmem238A9JSM3 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tmem238A9JSM3 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tmem238A9JSM3 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tmem238A9JSM3 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tmem238A9JSM3 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tmem238A9JSM3 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tmem238A9JSM3 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tmem238A9JSM3 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tmem238A9JSM3 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tmem238A9JSM3 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tmem238A9JSM3 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tmem238A9JSM3 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tmem238A9JSM3 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Tmem238A9JSM3 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tmem238A9JSM3 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tmem238A9JSM3 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tmem238A9JSM3 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tmem238A9JSM3 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tmem238A9JSM3 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Tmem238A9JSM3 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tmem238A9JSM3 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tmem238A9JSM3 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tmem238A9JSM3 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tmem238A9JSM3 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tmem238A9JSM3 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tmem238A9JSM3 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tmem238A9JSM3 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tmem238A9JSM3 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tmem238A9JSM3 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tmem238A9JSM3 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tmem238A9JSM3 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tmem238A9JSM3 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tmem238A9JSM3 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tmem238A9JSM3 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tmem238A9JSM3 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tmem238A9JSM3 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tmem238A9JSM3 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tmem238A9JSM3 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tmem238A9JSM3 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tmem238A9JSM3 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tmem238A9JSM3 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tmem238A9JSM3 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tmem238A9JSM3 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tmem238A9JSM3 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tmem238A9JSM3 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tmem238A9JSM3 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tmem238A9JSM3 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tmem238A9JSM3 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tmem238A9JSM3 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tmem238A9JSM3 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tmem238A9JSM3 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tmem238A9JSM3 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tmem238A9JSM3 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tmem238A9JSM3 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tmem238A9JSM3 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tmem238A9JSM3 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tmem238A9JSM3 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tmem238A9JSM3 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tmem238A9JSM3 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tmem238A9JSM3 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tmem238A9JSM3 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tmem238A9JSM3 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tmem238A9JSM3 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tmem238A9JSM3 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tmem238A9JSM3 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tmem238A9JSM3 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tmem238A9JSM3 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tmem238A9JSM3 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tmem238A9JSM3 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tmem238A9JSM3 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tmem238A9JSM3 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Tmem238A9JSM3 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Tmem238A9JSM3 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Tmem238A9JSM3 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tmem238A9JSM3 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tmem238A9JSM3 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tmem238A9JSM3 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tmem238A9JSM3 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tmem238A9JSM3 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tmem238A9JSM3 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tmem238A9JSM3 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tmem238A9JSM3 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tmem238A9JSM3 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tmem238A9JSM3 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tmem238A9JSM3 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tmem238A9JSM3 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tmem238A9JSM3 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tmem238A9JSM3 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.3 ms