Protein–RNA interactions for Protein: A4UUI3

Gbp4, Guanylate binding protein 4.1, mousemouse

Predictions only

Length 631 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gbp4A4UUI3 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Gbp4A4UUI3 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Gbp4A4UUI3 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Gbp4A4UUI3 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Gbp4A4UUI3 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Gbp4A4UUI3 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Gbp4A4UUI3 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Gbp4A4UUI3 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Gbp4A4UUI3 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Gbp4A4UUI3 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Gbp4A4UUI3 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Gbp4A4UUI3 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Gbp4A4UUI3 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Gbp4A4UUI3 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gbp4A4UUI3 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gbp4A4UUI3 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gbp4A4UUI3 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gbp4A4UUI3 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gbp4A4UUI3 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gbp4A4UUI3 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Gbp4A4UUI3 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Gbp4A4UUI3 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Gbp4A4UUI3 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Gbp4A4UUI3 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Gbp4A4UUI3 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Gbp4A4UUI3 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Gbp4A4UUI3 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Gbp4A4UUI3 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Gbp4A4UUI3 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Gbp4A4UUI3 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Gbp4A4UUI3 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Gbp4A4UUI3 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Gbp4A4UUI3 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Gbp4A4UUI3 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Gbp4A4UUI3 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Gbp4A4UUI3 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Gbp4A4UUI3 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Gbp4A4UUI3 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Gbp4A4UUI3 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Gbp4A4UUI3 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Gbp4A4UUI3 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Gbp4A4UUI3 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Gbp4A4UUI3 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Gbp4A4UUI3 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Gbp4A4UUI3 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Gbp4A4UUI3 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Gbp4A4UUI3 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Gbp4A4UUI3 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Gbp4A4UUI3 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Gbp4A4UUI3 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Gbp4A4UUI3 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Gbp4A4UUI3 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Gbp4A4UUI3 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Gbp4A4UUI3 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Gbp4A4UUI3 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Gbp4A4UUI3 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Gbp4A4UUI3 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Gbp4A4UUI3 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Gbp4A4UUI3 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Gbp4A4UUI3 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Gbp4A4UUI3 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Gbp4A4UUI3 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Gbp4A4UUI3 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Gbp4A4UUI3 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Gbp4A4UUI3 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Gbp4A4UUI3 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Gbp4A4UUI3 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Gbp4A4UUI3 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Gbp4A4UUI3 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Gbp4A4UUI3 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gbp4A4UUI3 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gbp4A4UUI3 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gbp4A4UUI3 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gbp4A4UUI3 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gbp4A4UUI3 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gbp4A4UUI3 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Gbp4A4UUI3 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Gbp4A4UUI3 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Gbp4A4UUI3 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gbp4A4UUI3 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gbp4A4UUI3 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Gbp4A4UUI3 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gbp4A4UUI3 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gbp4A4UUI3 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gbp4A4UUI3 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gbp4A4UUI3 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gbp4A4UUI3 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gbp4A4UUI3 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gbp4A4UUI3 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gbp4A4UUI3 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gbp4A4UUI3 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gbp4A4UUI3 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gbp4A4UUI3 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gbp4A4UUI3 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Gbp4A4UUI3 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Gbp4A4UUI3 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Gbp4A4UUI3 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Gbp4A4UUI3 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Gbp4A4UUI3 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Gbp4A4UUI3 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.6 ms