Protein–RNA interactions for Protein: A2ARM1

Patl2, Protein PAT1 homolog 2, mousemouse

Predictions only

Length 529 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Patl2A2ARM1 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Patl2A2ARM1 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Patl2A2ARM1 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Patl2A2ARM1 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Patl2A2ARM1 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Patl2A2ARM1 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Patl2A2ARM1 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Patl2A2ARM1 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Patl2A2ARM1 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Patl2A2ARM1 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Patl2A2ARM1 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Patl2A2ARM1 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Patl2A2ARM1 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Patl2A2ARM1 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Patl2A2ARM1 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Patl2A2ARM1 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Patl2A2ARM1 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Patl2A2ARM1 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Patl2A2ARM1 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Patl2A2ARM1 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Patl2A2ARM1 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Patl2A2ARM1 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Patl2A2ARM1 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Patl2A2ARM1 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Patl2A2ARM1 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Patl2A2ARM1 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Patl2A2ARM1 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Patl2A2ARM1 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Patl2A2ARM1 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Patl2A2ARM1 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Patl2A2ARM1 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Patl2A2ARM1 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Patl2A2ARM1 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Patl2A2ARM1 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Patl2A2ARM1 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Patl2A2ARM1 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Patl2A2ARM1 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Patl2A2ARM1 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Patl2A2ARM1 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Patl2A2ARM1 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Patl2A2ARM1 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Patl2A2ARM1 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Patl2A2ARM1 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Patl2A2ARM1 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Patl2A2ARM1 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Patl2A2ARM1 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Patl2A2ARM1 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Patl2A2ARM1 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Patl2A2ARM1 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Patl2A2ARM1 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Patl2A2ARM1 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Patl2A2ARM1 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Patl2A2ARM1 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Patl2A2ARM1 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Patl2A2ARM1 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Patl2A2ARM1 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Patl2A2ARM1 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Patl2A2ARM1 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Patl2A2ARM1 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Patl2A2ARM1 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Patl2A2ARM1 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Patl2A2ARM1 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Patl2A2ARM1 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Patl2A2ARM1 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
Patl2A2ARM1 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Patl2A2ARM1 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Patl2A2ARM1 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Patl2A2ARM1 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Patl2A2ARM1 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Patl2A2ARM1 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Patl2A2ARM1 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Patl2A2ARM1 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Patl2A2ARM1 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Patl2A2ARM1 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Patl2A2ARM1 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Patl2A2ARM1 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Patl2A2ARM1 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Patl2A2ARM1 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Patl2A2ARM1 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Patl2A2ARM1 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Patl2A2ARM1 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Patl2A2ARM1 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Patl2A2ARM1 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Patl2A2ARM1 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Patl2A2ARM1 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Patl2A2ARM1 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Patl2A2ARM1 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Patl2A2ARM1 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Patl2A2ARM1 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Patl2A2ARM1 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Patl2A2ARM1 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Patl2A2ARM1 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Patl2A2ARM1 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Patl2A2ARM1 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Patl2A2ARM1 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Patl2A2ARM1 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Patl2A2ARM1 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Patl2A2ARM1 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Patl2A2ARM1 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Patl2A2ARM1 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56 ms