Protein–RNA interactions for Protein: A2AJK6

Chd7, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 7, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,986 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chd7A2AJK6 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Chd7A2AJK6 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Chd7A2AJK6 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Chd7A2AJK6 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Chd7A2AJK6 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Chd7A2AJK6 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Chd7A2AJK6 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Chd7A2AJK6 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Chd7A2AJK6 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Chd7A2AJK6 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Chd7A2AJK6 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Chd7A2AJK6 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Chd7A2AJK6 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Chd7A2AJK6 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Chd7A2AJK6 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Chd7A2AJK6 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Chd7A2AJK6 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Chd7A2AJK6 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Chd7A2AJK6 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Chd7A2AJK6 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Chd7A2AJK6 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Chd7A2AJK6 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Chd7A2AJK6 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Chd7A2AJK6 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Chd7A2AJK6 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Chd7A2AJK6 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Chd7A2AJK6 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Chd7A2AJK6 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Chd7A2AJK6 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Chd7A2AJK6 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
Chd7A2AJK6 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Chd7A2AJK6 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Chd7A2AJK6 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Chd7A2AJK6 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Chd7A2AJK6 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Chd7A2AJK6 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Chd7A2AJK6 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Chd7A2AJK6 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Chd7A2AJK6 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Chd7A2AJK6 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Chd7A2AJK6 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Chd7A2AJK6 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Chd7A2AJK6 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Chd7A2AJK6 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Chd7A2AJK6 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Chd7A2AJK6 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Chd7A2AJK6 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Chd7A2AJK6 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Chd7A2AJK6 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Chd7A2AJK6 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Chd7A2AJK6 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
Chd7A2AJK6 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Chd7A2AJK6 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Chd7A2AJK6 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Chd7A2AJK6 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Chd7A2AJK6 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Chd7A2AJK6 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Chd7A2AJK6 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Chd7A2AJK6 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Chd7A2AJK6 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Chd7A2AJK6 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Chd7A2AJK6 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Chd7A2AJK6 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Chd7A2AJK6 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Chd7A2AJK6 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Chd7A2AJK6 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Chd7A2AJK6 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Chd7A2AJK6 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Chd7A2AJK6 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Chd7A2AJK6 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Chd7A2AJK6 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Chd7A2AJK6 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Chd7A2AJK6 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Chd7A2AJK6 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Chd7A2AJK6 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Chd7A2AJK6 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Chd7A2AJK6 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Chd7A2AJK6 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Chd7A2AJK6 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Chd7A2AJK6 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Chd7A2AJK6 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Chd7A2AJK6 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Chd7A2AJK6 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Chd7A2AJK6 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Chd7A2AJK6 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Chd7A2AJK6 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Chd7A2AJK6 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Chd7A2AJK6 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Chd7A2AJK6 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Chd7A2AJK6 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Chd7A2AJK6 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Chd7A2AJK6 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Chd7A2AJK6 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Chd7A2AJK6 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Chd7A2AJK6 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Chd7A2AJK6 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Chd7A2AJK6 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Chd7A2AJK6 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Chd7A2AJK6 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Chd7A2AJK6 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.1 ms