Protein–RNA interactions for Protein: A2AJB1

Ccdc183, Coiled-coil domain-containing protein 183, mousemouse

Predictions only

Length 534 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc183A2AJB1 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Ccdc183A2AJB1 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Ccdc183A2AJB1 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Ccdc183A2AJB1 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Ccdc183A2AJB1 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Ccdc183A2AJB1 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Ccdc183A2AJB1 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Ccdc183A2AJB1 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Ccdc183A2AJB1 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Ccdc183A2AJB1 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Ccdc183A2AJB1 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Ccdc183A2AJB1 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Ccdc183A2AJB1 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Ccdc183A2AJB1 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Ccdc183A2AJB1 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Ccdc183A2AJB1 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Ccdc183A2AJB1 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Ccdc183A2AJB1 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Ccdc183A2AJB1 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Ccdc183A2AJB1 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Ccdc183A2AJB1 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Ccdc183A2AJB1 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Ccdc183A2AJB1 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Ccdc183A2AJB1 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
Ccdc183A2AJB1 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Ccdc183A2AJB1 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Ccdc183A2AJB1 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Ccdc183A2AJB1 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Ccdc183A2AJB1 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Ccdc183A2AJB1 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Ccdc183A2AJB1 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Ccdc183A2AJB1 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Ccdc183A2AJB1 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Ccdc183A2AJB1 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Ccdc183A2AJB1 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Ccdc183A2AJB1 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Ccdc183A2AJB1 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Ccdc183A2AJB1 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Ccdc183A2AJB1 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Ccdc183A2AJB1 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Ccdc183A2AJB1 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Ccdc183A2AJB1 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Ccdc183A2AJB1 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Ccdc183A2AJB1 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Ccdc183A2AJB1 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Ccdc183A2AJB1 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Ccdc183A2AJB1 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Ccdc183A2AJB1 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Ccdc183A2AJB1 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Ccdc183A2AJB1 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Ccdc183A2AJB1 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Ccdc183A2AJB1 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Ccdc183A2AJB1 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Ccdc183A2AJB1 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Ccdc183A2AJB1 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Ccdc183A2AJB1 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Ccdc183A2AJB1 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Ccdc183A2AJB1 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Ccdc183A2AJB1 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Ccdc183A2AJB1 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Ccdc183A2AJB1 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Ccdc183A2AJB1 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Ccdc183A2AJB1 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Ccdc183A2AJB1 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Ccdc183A2AJB1 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Ccdc183A2AJB1 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Ccdc183A2AJB1 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Ccdc183A2AJB1 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Ccdc183A2AJB1 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Ccdc183A2AJB1 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Ccdc183A2AJB1 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Ccdc183A2AJB1 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Ccdc183A2AJB1 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Ccdc183A2AJB1 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Ccdc183A2AJB1 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Ccdc183A2AJB1 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Ccdc183A2AJB1 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Ccdc183A2AJB1 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Ccdc183A2AJB1 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Ccdc183A2AJB1 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Ccdc183A2AJB1 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Ccdc183A2AJB1 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Ccdc183A2AJB1 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Ccdc183A2AJB1 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Ccdc183A2AJB1 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Ccdc183A2AJB1 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Ccdc183A2AJB1 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
Ccdc183A2AJB1 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Ccdc183A2AJB1 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Ccdc183A2AJB1 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Ccdc183A2AJB1 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Ccdc183A2AJB1 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Ccdc183A2AJB1 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Ccdc183A2AJB1 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Ccdc183A2AJB1 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Ccdc183A2AJB1 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Ccdc183A2AJB1 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Ccdc183A2AJB1 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Ccdc183A2AJB1 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Ccdc183A2AJB1 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.3 ms