Protein–RNA interactions for Protein: A2AJ38

Gm13941, Predicted gene 13941 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 245 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm13941A2AJ38 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Gm13941A2AJ38 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Gm13941A2AJ38 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Gm13941A2AJ38 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Gm13941A2AJ38 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Gm13941A2AJ38 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Gm13941A2AJ38 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
Gm13941A2AJ38 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Gm13941A2AJ38 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Gm13941A2AJ38 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Gm13941A2AJ38 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Gm13941A2AJ38 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Gm13941A2AJ38 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Gm13941A2AJ38 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Gm13941A2AJ38 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Gm13941A2AJ38 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Gm13941A2AJ38 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Gm13941A2AJ38 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Gm13941A2AJ38 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Gm13941A2AJ38 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Gm13941A2AJ38 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Gm13941A2AJ38 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Gm13941A2AJ38 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Gm13941A2AJ38 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Gm13941A2AJ38 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Gm13941A2AJ38 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Gm13941A2AJ38 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Gm13941A2AJ38 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
Gm13941A2AJ38 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Gm13941A2AJ38 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Gm13941A2AJ38 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Gm13941A2AJ38 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Gm13941A2AJ38 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Gm13941A2AJ38 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Gm13941A2AJ38 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Gm13941A2AJ38 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Gm13941A2AJ38 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Gm13941A2AJ38 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Gm13941A2AJ38 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Gm13941A2AJ38 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Gm13941A2AJ38 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Gm13941A2AJ38 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Gm13941A2AJ38 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Gm13941A2AJ38 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Gm13941A2AJ38 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Gm13941A2AJ38 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Gm13941A2AJ38 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Gm13941A2AJ38 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
Gm13941A2AJ38 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Gm13941A2AJ38 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
Gm13941A2AJ38 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Gm13941A2AJ38 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Gm13941A2AJ38 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Gm13941A2AJ38 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Gm13941A2AJ38 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Gm13941A2AJ38 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Gm13941A2AJ38 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Gm13941A2AJ38 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Gm13941A2AJ38 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Gm13941A2AJ38 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Gm13941A2AJ38 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
Gm13941A2AJ38 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Gm13941A2AJ38 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Gm13941A2AJ38 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Gm13941A2AJ38 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Gm13941A2AJ38 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Gm13941A2AJ38 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Gm13941A2AJ38 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Gm13941A2AJ38 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Gm13941A2AJ38 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Gm13941A2AJ38 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Gm13941A2AJ38 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Gm13941A2AJ38 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Gm13941A2AJ38 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Gm13941A2AJ38 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Gm13941A2AJ38 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Gm13941A2AJ38 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Gm13941A2AJ38 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Gm13941A2AJ38 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
Gm13941A2AJ38 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
Gm13941A2AJ38 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
Gm13941A2AJ38 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Gm13941A2AJ38 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Gm13941A2AJ38 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
Gm13941A2AJ38 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Gm13941A2AJ38 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Gm13941A2AJ38 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
Gm13941A2AJ38 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Gm13941A2AJ38 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Gm13941A2AJ38 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Gm13941A2AJ38 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Gm13941A2AJ38 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Gm13941A2AJ38 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Gm13941A2AJ38 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Gm13941A2AJ38 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Gm13941A2AJ38 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Gm13941A2AJ38 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Gm13941A2AJ38 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Gm13941A2AJ38 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Gm13941A2AJ38 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.7 ms