Protein–RNA interactions for Protein: A2AFH2

Ube2dnl2, Similar to ubiquitin-conjugating enzyme E2D 2, mousemouse

Predictions only

Length 155 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2dnl2A2AFH2 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Ube2dnl2A2AFH2 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Ube2dnl2A2AFH2 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Ube2dnl2A2AFH2 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Ube2dnl2A2AFH2 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Ube2dnl2A2AFH2 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
Ube2dnl2A2AFH2 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Ube2dnl2A2AFH2 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Ube2dnl2A2AFH2 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Ube2dnl2A2AFH2 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Ube2dnl2A2AFH2 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ube2dnl2A2AFH2 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ube2dnl2A2AFH2 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ube2dnl2A2AFH2 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ube2dnl2A2AFH2 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ube2dnl2A2AFH2 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ube2dnl2A2AFH2 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ube2dnl2A2AFH2 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ube2dnl2A2AFH2 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ube2dnl2A2AFH2 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ube2dnl2A2AFH2 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ube2dnl2A2AFH2 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ube2dnl2A2AFH2 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ube2dnl2A2AFH2 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
Ube2dnl2A2AFH2 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
Ube2dnl2A2AFH2 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ube2dnl2A2AFH2 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ube2dnl2A2AFH2 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ube2dnl2A2AFH2 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ube2dnl2A2AFH2 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ube2dnl2A2AFH2 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ube2dnl2A2AFH2 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ube2dnl2A2AFH2 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Ube2dnl2A2AFH2 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Ube2dnl2A2AFH2 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Ube2dnl2A2AFH2 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Ube2dnl2A2AFH2 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Ube2dnl2A2AFH2 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ube2dnl2A2AFH2 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ube2dnl2A2AFH2 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ube2dnl2A2AFH2 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ube2dnl2A2AFH2 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ube2dnl2A2AFH2 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ube2dnl2A2AFH2 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ube2dnl2A2AFH2 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ube2dnl2A2AFH2 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ube2dnl2A2AFH2 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ube2dnl2A2AFH2 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ube2dnl2A2AFH2 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ube2dnl2A2AFH2 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ube2dnl2A2AFH2 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Ube2dnl2A2AFH2 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ube2dnl2A2AFH2 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Ube2dnl2A2AFH2 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ube2dnl2A2AFH2 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ube2dnl2A2AFH2 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Ube2dnl2A2AFH2 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ube2dnl2A2AFH2 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ube2dnl2A2AFH2 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ube2dnl2A2AFH2 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ube2dnl2A2AFH2 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ube2dnl2A2AFH2 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ube2dnl2A2AFH2 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ube2dnl2A2AFH2 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ube2dnl2A2AFH2 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ube2dnl2A2AFH2 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ube2dnl2A2AFH2 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ube2dnl2A2AFH2 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ube2dnl2A2AFH2 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ube2dnl2A2AFH2 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ube2dnl2A2AFH2 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ube2dnl2A2AFH2 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ube2dnl2A2AFH2 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ube2dnl2A2AFH2 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ube2dnl2A2AFH2 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ube2dnl2A2AFH2 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ube2dnl2A2AFH2 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ube2dnl2A2AFH2 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ube2dnl2A2AFH2 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ube2dnl2A2AFH2 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ube2dnl2A2AFH2 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ube2dnl2A2AFH2 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ube2dnl2A2AFH2 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ube2dnl2A2AFH2 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ube2dnl2A2AFH2 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ube2dnl2A2AFH2 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ube2dnl2A2AFH2 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ube2dnl2A2AFH2 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ube2dnl2A2AFH2 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ube2dnl2A2AFH2 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ube2dnl2A2AFH2 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ube2dnl2A2AFH2 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ube2dnl2A2AFH2 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ube2dnl2A2AFH2 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ube2dnl2A2AFH2 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Ube2dnl2A2AFH2 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ube2dnl2A2AFH2 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ube2dnl2A2AFH2 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ube2dnl2A2AFH2 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ube2dnl2A2AFH2 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8.7 ms