Protein–RNA interactions for Protein: A2ACT7

Col9a3, Collagen, type IX, alpha 3, mousemouse

Predictions only

Length 680 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col9a3A2ACT7 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Col9a3A2ACT7 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Col9a3A2ACT7 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Col9a3A2ACT7 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Col9a3A2ACT7 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Col9a3A2ACT7 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Col9a3A2ACT7 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Col9a3A2ACT7 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Col9a3A2ACT7 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Col9a3A2ACT7 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Col9a3A2ACT7 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Col9a3A2ACT7 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Col9a3A2ACT7 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Col9a3A2ACT7 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Col9a3A2ACT7 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Col9a3A2ACT7 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Col9a3A2ACT7 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Col9a3A2ACT7 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Col9a3A2ACT7 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Col9a3A2ACT7 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Col9a3A2ACT7 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Col9a3A2ACT7 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Col9a3A2ACT7 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Col9a3A2ACT7 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Col9a3A2ACT7 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Col9a3A2ACT7 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Col9a3A2ACT7 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Col9a3A2ACT7 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Col9a3A2ACT7 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Col9a3A2ACT7 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Col9a3A2ACT7 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Col9a3A2ACT7 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Col9a3A2ACT7 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Col9a3A2ACT7 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Col9a3A2ACT7 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Col9a3A2ACT7 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Col9a3A2ACT7 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Col9a3A2ACT7 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Col9a3A2ACT7 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Col9a3A2ACT7 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Col9a3A2ACT7 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Col9a3A2ACT7 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Col9a3A2ACT7 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Col9a3A2ACT7 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Col9a3A2ACT7 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Col9a3A2ACT7 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Col9a3A2ACT7 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Col9a3A2ACT7 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Col9a3A2ACT7 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Col9a3A2ACT7 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Col9a3A2ACT7 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Col9a3A2ACT7 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Col9a3A2ACT7 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Col9a3A2ACT7 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Col9a3A2ACT7 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Col9a3A2ACT7 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Col9a3A2ACT7 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Col9a3A2ACT7 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Col9a3A2ACT7 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Col9a3A2ACT7 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Col9a3A2ACT7 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Col9a3A2ACT7 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Col9a3A2ACT7 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Col9a3A2ACT7 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Col9a3A2ACT7 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Col9a3A2ACT7 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Col9a3A2ACT7 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Col9a3A2ACT7 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Col9a3A2ACT7 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Col9a3A2ACT7 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Col9a3A2ACT7 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Col9a3A2ACT7 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Col9a3A2ACT7 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Col9a3A2ACT7 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Col9a3A2ACT7 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Col9a3A2ACT7 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Col9a3A2ACT7 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Col9a3A2ACT7 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Col9a3A2ACT7 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Col9a3A2ACT7 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Col9a3A2ACT7 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Col9a3A2ACT7 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Col9a3A2ACT7 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Col9a3A2ACT7 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Col9a3A2ACT7 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Col9a3A2ACT7 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Col9a3A2ACT7 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Col9a3A2ACT7 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Col9a3A2ACT7 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Col9a3A2ACT7 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Col9a3A2ACT7 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Col9a3A2ACT7 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Col9a3A2ACT7 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Col9a3A2ACT7 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Col9a3A2ACT7 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Col9a3A2ACT7 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Col9a3A2ACT7 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Col9a3A2ACT7 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Col9a3A2ACT7 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Col9a3A2ACT7 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms