Protein–RNA interactions for Protein: A2A654

Bptf, Bromodomain PHD finger transcription factor, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 3,036 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BptfA2A654 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
BptfA2A654 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
BptfA2A654 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
BptfA2A654 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
BptfA2A654 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
BptfA2A654 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
BptfA2A654 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
BptfA2A654 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
BptfA2A654 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
BptfA2A654 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
BptfA2A654 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
BptfA2A654 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
BptfA2A654 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
BptfA2A654 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
BptfA2A654 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
BptfA2A654 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
BptfA2A654 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
BptfA2A654 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
BptfA2A654 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
BptfA2A654 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
BptfA2A654 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
BptfA2A654 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
BptfA2A654 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
BptfA2A654 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
BptfA2A654 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
BptfA2A654 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
BptfA2A654 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
BptfA2A654 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
BptfA2A654 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
BptfA2A654 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
BptfA2A654 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
BptfA2A654 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
BptfA2A654 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
BptfA2A654 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
BptfA2A654 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
BptfA2A654 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
BptfA2A654 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
BptfA2A654 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
BptfA2A654 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
BptfA2A654 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
BptfA2A654 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
BptfA2A654 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
BptfA2A654 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
BptfA2A654 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
BptfA2A654 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
BptfA2A654 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
BptfA2A654 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
BptfA2A654 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
BptfA2A654 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
BptfA2A654 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
BptfA2A654 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
BptfA2A654 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
BptfA2A654 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.06
BptfA2A654 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
BptfA2A654 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
BptfA2A654 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
BptfA2A654 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
BptfA2A654 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
BptfA2A654 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
BptfA2A654 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
BptfA2A654 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
BptfA2A654 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
BptfA2A654 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
BptfA2A654 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
BptfA2A654 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
BptfA2A654 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
BptfA2A654 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
BptfA2A654 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
BptfA2A654 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
BptfA2A654 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
BptfA2A654 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
BptfA2A654 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
BptfA2A654 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
BptfA2A654 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
BptfA2A654 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
BptfA2A654 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
BptfA2A654 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
BptfA2A654 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
BptfA2A654 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
BptfA2A654 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
BptfA2A654 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
BptfA2A654 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
BptfA2A654 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
BptfA2A654 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
BptfA2A654 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
BptfA2A654 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
BptfA2A654 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
BptfA2A654 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
BptfA2A654 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
BptfA2A654 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
BptfA2A654 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
BptfA2A654 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
BptfA2A654 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
BptfA2A654 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
BptfA2A654 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
BptfA2A654 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
BptfA2A654 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
BptfA2A654 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
BptfA2A654 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
BptfA2A654 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms