Protein–RNA interactions for Protein: A2A3U9

Gm6268, Predicted gene 6268, mousemouse

Predictions only

Length 297 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm6268A2A3U9 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Gm6268A2A3U9 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Gm6268A2A3U9 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Gm6268A2A3U9 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Gm6268A2A3U9 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC29.22■■■□□ 2.27
Gm6268A2A3U9 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Gm6268A2A3U9 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Gm6268A2A3U9 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
Gm6268A2A3U9 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
Gm6268A2A3U9 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Gm6268A2A3U9 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
Gm6268A2A3U9 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC29.2■■■□□ 2.26
Gm6268A2A3U9 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Gm6268A2A3U9 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Gm6268A2A3U9 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Gm6268A2A3U9 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Gm6268A2A3U9 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Gm6268A2A3U9 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Gm6268A2A3U9 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Gm6268A2A3U9 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
Gm6268A2A3U9 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Gm6268A2A3U9 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Gm6268A2A3U9 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Gm6268A2A3U9 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Gm6268A2A3U9 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
Gm6268A2A3U9 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Gm6268A2A3U9 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Gm6268A2A3U9 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC29.16■■■□□ 2.26
Gm6268A2A3U9 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Gm6268A2A3U9 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Gm6268A2A3U9 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Gm6268A2A3U9 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC29.15■■■□□ 2.26
Gm6268A2A3U9 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Gm6268A2A3U9 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Gm6268A2A3U9 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Gm6268A2A3U9 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Gm6268A2A3U9 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
Gm6268A2A3U9 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Gm6268A2A3U9 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Gm6268A2A3U9 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Gm6268A2A3U9 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Gm6268A2A3U9 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC29.13■■■□□ 2.25
Gm6268A2A3U9 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
Gm6268A2A3U9 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Gm6268A2A3U9 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Gm6268A2A3U9 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Gm6268A2A3U9 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Gm6268A2A3U9 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
Gm6268A2A3U9 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Gm6268A2A3U9 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Gm6268A2A3U9 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Gm6268A2A3U9 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Gm6268A2A3U9 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC29.11■■■□□ 2.25
Gm6268A2A3U9 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Gm6268A2A3U9 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Gm6268A2A3U9 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Gm6268A2A3U9 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Gm6268A2A3U9 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
Gm6268A2A3U9 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
Gm6268A2A3U9 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC29.08■■■□□ 2.25
Gm6268A2A3U9 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
Gm6268A2A3U9 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Gm6268A2A3U9 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Gm6268A2A3U9 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
Gm6268A2A3U9 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.24
Gm6268A2A3U9 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
Gm6268A2A3U9 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC29.07■■■□□ 2.24
Gm6268A2A3U9 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Gm6268A2A3U9 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Gm6268A2A3U9 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Gm6268A2A3U9 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
Gm6268A2A3U9 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
Gm6268A2A3U9 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
Gm6268A2A3U9 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Gm6268A2A3U9 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Gm6268A2A3U9 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Gm6268A2A3U9 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Gm6268A2A3U9 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Gm6268A2A3U9 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Gm6268A2A3U9 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Gm6268A2A3U9 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
Gm6268A2A3U9 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Gm6268A2A3U9 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Gm6268A2A3U9 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Gm6268A2A3U9 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Gm6268A2A3U9 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Gm6268A2A3U9 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Gm6268A2A3U9 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Gm6268A2A3U9 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Gm6268A2A3U9 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Gm6268A2A3U9 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Gm6268A2A3U9 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC29■■■□□ 2.23
Gm6268A2A3U9 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Gm6268A2A3U9 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC28.99■■■□□ 2.23
Gm6268A2A3U9 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Gm6268A2A3U9 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Gm6268A2A3U9 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
Gm6268A2A3U9 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
Gm6268A2A3U9 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Gm6268A2A3U9 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms