Protein–RNA interactions for Protein: A0A0U1RQ45

6430628N08Rik, MCG1049118, mousemouse

Predictions only

Length 177 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
6430628N08RikA0A0U1RQ45 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
6430628N08RikA0A0U1RQ45 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
6430628N08RikA0A0U1RQ45 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
6430628N08RikA0A0U1RQ45 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC20■□□□□ 0.79
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
6430628N08RikA0A0U1RQ45 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
6430628N08RikA0A0U1RQ45 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
6430628N08RikA0A0U1RQ45 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.7 ms