Protein–RNA interactions for Protein: Q99LD4

Gps1, COP9 signalosome complex subunit 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 471 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gps1Q99LD4 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gps1Q99LD4 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gps1Q99LD4 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gps1Q99LD4 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gps1Q99LD4 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gps1Q99LD4 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gps1Q99LD4 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gps1Q99LD4 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gps1Q99LD4 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gps1Q99LD4 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gps1Q99LD4 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gps1Q99LD4 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gps1Q99LD4 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gps1Q99LD4 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gps1Q99LD4 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gps1Q99LD4 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gps1Q99LD4 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gps1Q99LD4 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gps1Q99LD4 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Gps1Q99LD4 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gps1Q99LD4 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gps1Q99LD4 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gps1Q99LD4 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gps1Q99LD4 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gps1Q99LD4 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Gps1Q99LD4 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gps1Q99LD4 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gps1Q99LD4 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gps1Q99LD4 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gps1Q99LD4 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gps1Q99LD4 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gps1Q99LD4 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gps1Q99LD4 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gps1Q99LD4 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gps1Q99LD4 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gps1Q99LD4 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gps1Q99LD4 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Gps1Q99LD4 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gps1Q99LD4 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gps1Q99LD4 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gps1Q99LD4 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gps1Q99LD4 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gps1Q99LD4 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gps1Q99LD4 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gps1Q99LD4 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gps1Q99LD4 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gps1Q99LD4 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gps1Q99LD4 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gps1Q99LD4 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gps1Q99LD4 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gps1Q99LD4 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Gps1Q99LD4 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gps1Q99LD4 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gps1Q99LD4 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gps1Q99LD4 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gps1Q99LD4 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gps1Q99LD4 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gps1Q99LD4 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gps1Q99LD4 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gps1Q99LD4 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gps1Q99LD4 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gps1Q99LD4 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gps1Q99LD4 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gps1Q99LD4 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gps1Q99LD4 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gps1Q99LD4 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gps1Q99LD4 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gps1Q99LD4 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gps1Q99LD4 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gps1Q99LD4 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gps1Q99LD4 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gps1Q99LD4 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gps1Q99LD4 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gps1Q99LD4 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gps1Q99LD4 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gps1Q99LD4 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gps1Q99LD4 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gps1Q99LD4 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gps1Q99LD4 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gps1Q99LD4 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gps1Q99LD4 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gps1Q99LD4 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gps1Q99LD4 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gps1Q99LD4 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gps1Q99LD4 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gps1Q99LD4 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gps1Q99LD4 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gps1Q99LD4 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gps1Q99LD4 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gps1Q99LD4 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gps1Q99LD4 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gps1Q99LD4 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gps1Q99LD4 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gps1Q99LD4 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Gps1Q99LD4 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gps1Q99LD4 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gps1Q99LD4 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gps1Q99LD4 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gps1Q99LD4 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gps1Q99LD4 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.7 ms