Protein–RNA interactions for Protein: P29974

Cnga1, cGMP-gated cation channel alpha-1, mousemouse

Predictions only

Length 684 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnga1P29974 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cnga1P29974 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cnga1P29974 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cnga1P29974 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cnga1P29974 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cnga1P29974 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cnga1P29974 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cnga1P29974 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cnga1P29974 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cnga1P29974 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cnga1P29974 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Cnga1P29974 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Cnga1P29974 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Cnga1P29974 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cnga1P29974 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cnga1P29974 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Cnga1P29974 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cnga1P29974 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cnga1P29974 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cnga1P29974 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cnga1P29974 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cnga1P29974 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cnga1P29974 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cnga1P29974 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cnga1P29974 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cnga1P29974 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cnga1P29974 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cnga1P29974 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cnga1P29974 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Cnga1P29974 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cnga1P29974 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cnga1P29974 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cnga1P29974 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cnga1P29974 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cnga1P29974 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cnga1P29974 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cnga1P29974 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cnga1P29974 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cnga1P29974 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cnga1P29974 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
Cnga1P29974 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Cnga1P29974 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Cnga1P29974 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Cnga1P29974 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Cnga1P29974 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Cnga1P29974 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Cnga1P29974 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Cnga1P29974 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Cnga1P29974 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Cnga1P29974 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Cnga1P29974 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Cnga1P29974 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Cnga1P29974 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Cnga1P29974 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Cnga1P29974 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Cnga1P29974 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Cnga1P29974 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Cnga1P29974 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Cnga1P29974 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Cnga1P29974 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Cnga1P29974 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Cnga1P29974 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Cnga1P29974 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Cnga1P29974 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Cnga1P29974 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Cnga1P29974 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Cnga1P29974 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Cnga1P29974 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Cnga1P29974 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Cnga1P29974 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Cnga1P29974 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Cnga1P29974 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Cnga1P29974 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Cnga1P29974 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Cnga1P29974 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Cnga1P29974 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Cnga1P29974 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Cnga1P29974 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Cnga1P29974 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Cnga1P29974 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Cnga1P29974 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Cnga1P29974 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Cnga1P29974 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Cnga1P29974 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Cnga1P29974 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Cnga1P29974 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Cnga1P29974 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Cnga1P29974 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Cnga1P29974 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Cnga1P29974 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Cnga1P29974 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Cnga1P29974 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Cnga1P29974 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Cnga1P29974 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Cnga1P29974 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Cnga1P29974 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Cnga1P29974 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Cnga1P29974 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Cnga1P29974 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Cnga1P29974 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.9 ms