Protein–RNA interactions for Protein: P15409

Rho, Rhodopsin, mousemouse

Predictions only

Length 348 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RhoP15409 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RhoP15409 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RhoP15409 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RhoP15409 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RhoP15409 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RhoP15409 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RhoP15409 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RhoP15409 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RhoP15409 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RhoP15409 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RhoP15409 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RhoP15409 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RhoP15409 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RhoP15409 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RhoP15409 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
RhoP15409 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RhoP15409 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
RhoP15409 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RhoP15409 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
RhoP15409 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RhoP15409 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RhoP15409 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RhoP15409 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RhoP15409 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RhoP15409 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RhoP15409 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
RhoP15409 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RhoP15409 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RhoP15409 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RhoP15409 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RhoP15409 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RhoP15409 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RhoP15409 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RhoP15409 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RhoP15409 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RhoP15409 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RhoP15409 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RhoP15409 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RhoP15409 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RhoP15409 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RhoP15409 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RhoP15409 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RhoP15409 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RhoP15409 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RhoP15409 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RhoP15409 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RhoP15409 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
RhoP15409 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RhoP15409 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
RhoP15409 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RhoP15409 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RhoP15409 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
RhoP15409 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RhoP15409 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RhoP15409 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RhoP15409 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
RhoP15409 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
RhoP15409 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RhoP15409 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RhoP15409 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RhoP15409 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RhoP15409 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RhoP15409 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RhoP15409 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RhoP15409 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RhoP15409 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RhoP15409 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RhoP15409 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RhoP15409 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RhoP15409 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RhoP15409 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RhoP15409 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RhoP15409 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RhoP15409 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
RhoP15409 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RhoP15409 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RhoP15409 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RhoP15409 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RhoP15409 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RhoP15409 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RhoP15409 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RhoP15409 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RhoP15409 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RhoP15409 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RhoP15409 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RhoP15409 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RhoP15409 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RhoP15409 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RhoP15409 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RhoP15409 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RhoP15409 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RhoP15409 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RhoP15409 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
RhoP15409 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RhoP15409 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RhoP15409 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RhoP15409 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RhoP15409 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
RhoP15409 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RhoP15409 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75.7 ms