Protein–RNA interactions for Protein: Q6KCD5

Nipbl, Nipped-B-like protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,798 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NipblQ6KCD5 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
NipblQ6KCD5 Gm13066-201ENSMUST00000145263 884 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
NipblQ6KCD5 Otx2os1-202ENSMUST00000183803 743 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
NipblQ6KCD5 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
NipblQ6KCD5 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
NipblQ6KCD5 Gm45331-201ENSMUST00000209868 554 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
NipblQ6KCD5 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
NipblQ6KCD5 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
NipblQ6KCD5 1700120B22Rik-201ENSMUST00000054837 464 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
NipblQ6KCD5 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
NipblQ6KCD5 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
NipblQ6KCD5 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
NipblQ6KCD5 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
NipblQ6KCD5 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
NipblQ6KCD5 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
NipblQ6KCD5 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
NipblQ6KCD5 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
NipblQ6KCD5 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
NipblQ6KCD5 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
NipblQ6KCD5 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
NipblQ6KCD5 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
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NipblQ6KCD5 Gm15824-201ENSMUST00000119516 955 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
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NipblQ6KCD5 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
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NipblQ6KCD5 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
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NipblQ6KCD5 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
NipblQ6KCD5 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
NipblQ6KCD5 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
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NipblQ6KCD5 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
NipblQ6KCD5 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
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NipblQ6KCD5 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
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NipblQ6KCD5 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
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NipblQ6KCD5 Lamtor2-201ENSMUST00000029698 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
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NipblQ6KCD5 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
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NipblQ6KCD5 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
NipblQ6KCD5 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
NipblQ6KCD5 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
NipblQ6KCD5 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
NipblQ6KCD5 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
NipblQ6KCD5 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
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NipblQ6KCD5 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
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NipblQ6KCD5 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
NipblQ6KCD5 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
NipblQ6KCD5 AL593843.1-201ENSMUST00000195891 145 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
NipblQ6KCD5 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
NipblQ6KCD5 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
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NipblQ6KCD5 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
NipblQ6KCD5 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
NipblQ6KCD5 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
NipblQ6KCD5 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
NipblQ6KCD5 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
NipblQ6KCD5 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
NipblQ6KCD5 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
NipblQ6KCD5 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
NipblQ6KCD5 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
NipblQ6KCD5 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
NipblQ6KCD5 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
NipblQ6KCD5 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
NipblQ6KCD5 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
NipblQ6KCD5 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
NipblQ6KCD5 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
NipblQ6KCD5 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
NipblQ6KCD5 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.5 ms