Protein–RNA interactions for Protein: P09026

Hoxb3, Homeobox protein Hox-B3, mousemouse

Predictions only

Length 433 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb3P09026 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hoxb3P09026 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hoxb3P09026 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hoxb3P09026 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hoxb3P09026 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hoxb3P09026 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hoxb3P09026 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hoxb3P09026 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hoxb3P09026 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hoxb3P09026 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hoxb3P09026 Rgs19-204ENSMUST00000108772 779 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hoxb3P09026 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Hoxb3P09026 4932443L11Rik-201ENSMUST00000148353 414 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hoxb3P09026 Atpif1-203ENSMUST00000152993 462 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hoxb3P09026 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hoxb3P09026 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Hoxb3P09026 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Hoxb3P09026 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Hoxb3P09026 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Hoxb3P09026 Coprs-202ENSMUST00000209371 601 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hoxb3P09026 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hoxb3P09026 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hoxb3P09026 AC153962.4-201ENSMUST00000217878 242 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Hoxb3P09026 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hoxb3P09026 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hoxb3P09026 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hoxb3P09026 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Hoxb3P09026 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Hoxb3P09026 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Hoxb3P09026 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hoxb3P09026 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hoxb3P09026 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hoxb3P09026 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hoxb3P09026 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hoxb3P09026 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hoxb3P09026 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hoxb3P09026 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hoxb3P09026 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hoxb3P09026 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hoxb3P09026 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hoxb3P09026 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hoxb3P09026 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hoxb3P09026 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hoxb3P09026 Mbd3-202ENSMUST00000105347 914 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hoxb3P09026 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hoxb3P09026 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Hoxb3P09026 Cryzl1-204ENSMUST00000122254 845 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hoxb3P09026 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hoxb3P09026 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Hoxb3P09026 Gm35549-203ENSMUST00000204619 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hoxb3P09026 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hoxb3P09026 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hoxb3P09026 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hoxb3P09026 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hoxb3P09026 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hoxb3P09026 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hoxb3P09026 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hoxb3P09026 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hoxb3P09026 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hoxb3P09026 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hoxb3P09026 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hoxb3P09026 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hoxb3P09026 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hoxb3P09026 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hoxb3P09026 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hoxb3P09026 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hoxb3P09026 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hoxb3P09026 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hoxb3P09026 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hoxb3P09026 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hoxb3P09026 Gm16194-204ENSMUST00000141797 475 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hoxb3P09026 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hoxb3P09026 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Hoxb3P09026 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Hoxb3P09026 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hoxb3P09026 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hoxb3P09026 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hoxb3P09026 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hoxb3P09026 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hoxb3P09026 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hoxb3P09026 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hoxb3P09026 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hoxb3P09026 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hoxb3P09026 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hoxb3P09026 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hoxb3P09026 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hoxb3P09026 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hoxb3P09026 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hoxb3P09026 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hoxb3P09026 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hoxb3P09026 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hoxb3P09026 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hoxb3P09026 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hoxb3P09026 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hoxb3P09026 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hoxb3P09026 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hoxb3P09026 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hoxb3P09026 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hoxb3P09026 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hoxb3P09026 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 131.5 ms