Protein–RNA interactions for Protein: Q99LD4

Gps1, COP9 signalosome complex subunit 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 471 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gps1Q99LD4 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gps1Q99LD4 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gps1Q99LD4 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gps1Q99LD4 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gps1Q99LD4 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gps1Q99LD4 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gps1Q99LD4 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gps1Q99LD4 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gps1Q99LD4 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gps1Q99LD4 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gps1Q99LD4 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Gps1Q99LD4 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gps1Q99LD4 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gps1Q99LD4 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gps1Q99LD4 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gps1Q99LD4 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gps1Q99LD4 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gps1Q99LD4 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gps1Q99LD4 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gps1Q99LD4 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gps1Q99LD4 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gps1Q99LD4 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gps1Q99LD4 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gps1Q99LD4 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gps1Q99LD4 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gps1Q99LD4 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gps1Q99LD4 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gps1Q99LD4 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gps1Q99LD4 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gps1Q99LD4 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gps1Q99LD4 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gps1Q99LD4 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gps1Q99LD4 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gps1Q99LD4 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gps1Q99LD4 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gps1Q99LD4 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gps1Q99LD4 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gps1Q99LD4 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Gps1Q99LD4 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gps1Q99LD4 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gps1Q99LD4 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gps1Q99LD4 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gps1Q99LD4 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gps1Q99LD4 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Gps1Q99LD4 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gps1Q99LD4 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gps1Q99LD4 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gps1Q99LD4 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gps1Q99LD4 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gps1Q99LD4 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gps1Q99LD4 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gps1Q99LD4 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gps1Q99LD4 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gps1Q99LD4 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gps1Q99LD4 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gps1Q99LD4 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gps1Q99LD4 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gps1Q99LD4 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gps1Q99LD4 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gps1Q99LD4 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gps1Q99LD4 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gps1Q99LD4 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gps1Q99LD4 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gps1Q99LD4 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gps1Q99LD4 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gps1Q99LD4 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gps1Q99LD4 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gps1Q99LD4 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gps1Q99LD4 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gps1Q99LD4 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gps1Q99LD4 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gps1Q99LD4 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gps1Q99LD4 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gps1Q99LD4 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gps1Q99LD4 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gps1Q99LD4 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gps1Q99LD4 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gps1Q99LD4 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gps1Q99LD4 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gps1Q99LD4 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gps1Q99LD4 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gps1Q99LD4 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gps1Q99LD4 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gps1Q99LD4 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Gps1Q99LD4 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gps1Q99LD4 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gps1Q99LD4 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gps1Q99LD4 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gps1Q99LD4 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gps1Q99LD4 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gps1Q99LD4 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gps1Q99LD4 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gps1Q99LD4 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gps1Q99LD4 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gps1Q99LD4 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gps1Q99LD4 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gps1Q99LD4 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gps1Q99LD4 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gps1Q99LD4 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gps1Q99LD4 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.1 ms