Protein–RNA interactions for Protein: Q99LD4

Gps1, COP9 signalosome complex subunit 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 471 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gps1Q99LD4 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gps1Q99LD4 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gps1Q99LD4 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gps1Q99LD4 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gps1Q99LD4 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gps1Q99LD4 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gps1Q99LD4 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gps1Q99LD4 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gps1Q99LD4 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gps1Q99LD4 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gps1Q99LD4 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gps1Q99LD4 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Gps1Q99LD4 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gps1Q99LD4 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gps1Q99LD4 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gps1Q99LD4 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gps1Q99LD4 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gps1Q99LD4 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gps1Q99LD4 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gps1Q99LD4 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gps1Q99LD4 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gps1Q99LD4 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gps1Q99LD4 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gps1Q99LD4 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gps1Q99LD4 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gps1Q99LD4 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gps1Q99LD4 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gps1Q99LD4 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gps1Q99LD4 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gps1Q99LD4 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Gps1Q99LD4 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Gps1Q99LD4 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gps1Q99LD4 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Gps1Q99LD4 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gps1Q99LD4 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gps1Q99LD4 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gps1Q99LD4 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gps1Q99LD4 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gps1Q99LD4 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gps1Q99LD4 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gps1Q99LD4 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gps1Q99LD4 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gps1Q99LD4 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gps1Q99LD4 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gps1Q99LD4 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gps1Q99LD4 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gps1Q99LD4 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gps1Q99LD4 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gps1Q99LD4 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gps1Q99LD4 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gps1Q99LD4 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gps1Q99LD4 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gps1Q99LD4 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Gps1Q99LD4 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gps1Q99LD4 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gps1Q99LD4 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gps1Q99LD4 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gps1Q99LD4 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gps1Q99LD4 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gps1Q99LD4 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gps1Q99LD4 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gps1Q99LD4 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gps1Q99LD4 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gps1Q99LD4 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gps1Q99LD4 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gps1Q99LD4 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gps1Q99LD4 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gps1Q99LD4 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gps1Q99LD4 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gps1Q99LD4 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gps1Q99LD4 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gps1Q99LD4 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gps1Q99LD4 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gps1Q99LD4 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gps1Q99LD4 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gps1Q99LD4 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gps1Q99LD4 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gps1Q99LD4 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gps1Q99LD4 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gps1Q99LD4 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gps1Q99LD4 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gps1Q99LD4 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gps1Q99LD4 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gps1Q99LD4 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gps1Q99LD4 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gps1Q99LD4 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gps1Q99LD4 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gps1Q99LD4 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gps1Q99LD4 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Gps1Q99LD4 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gps1Q99LD4 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gps1Q99LD4 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gps1Q99LD4 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Gps1Q99LD4 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Gps1Q99LD4 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Gps1Q99LD4 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Gps1Q99LD4 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Gps1Q99LD4 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gps1Q99LD4 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gps1Q99LD4 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.1 ms