Protein–RNA interactions for Protein: Q3V3Q7

Pacs2, Phosphofurin acidic cluster sorting protein 2, mousemouse

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Length 862 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pacs2Q3V3Q7 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pacs2Q3V3Q7 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pacs2Q3V3Q7 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pacs2Q3V3Q7 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pacs2Q3V3Q7 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pacs2Q3V3Q7 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pacs2Q3V3Q7 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pacs2Q3V3Q7 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pacs2Q3V3Q7 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pacs2Q3V3Q7 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pacs2Q3V3Q7 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pacs2Q3V3Q7 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pacs2Q3V3Q7 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pacs2Q3V3Q7 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pacs2Q3V3Q7 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pacs2Q3V3Q7 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pacs2Q3V3Q7 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pacs2Q3V3Q7 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pacs2Q3V3Q7 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pacs2Q3V3Q7 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pacs2Q3V3Q7 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pacs2Q3V3Q7 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pacs2Q3V3Q7 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pacs2Q3V3Q7 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pacs2Q3V3Q7 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pacs2Q3V3Q7 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pacs2Q3V3Q7 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pacs2Q3V3Q7 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pacs2Q3V3Q7 Gm45609-204ENSMUST00000209837 1207 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pacs2Q3V3Q7 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pacs2Q3V3Q7 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pacs2Q3V3Q7 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pacs2Q3V3Q7 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pacs2Q3V3Q7 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pacs2Q3V3Q7 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pacs2Q3V3Q7 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pacs2Q3V3Q7 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pacs2Q3V3Q7 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pacs2Q3V3Q7 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pacs2Q3V3Q7 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pacs2Q3V3Q7 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pacs2Q3V3Q7 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pacs2Q3V3Q7 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Pacs2Q3V3Q7 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pacs2Q3V3Q7 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pacs2Q3V3Q7 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pacs2Q3V3Q7 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pacs2Q3V3Q7 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pacs2Q3V3Q7 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pacs2Q3V3Q7 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pacs2Q3V3Q7 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pacs2Q3V3Q7 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pacs2Q3V3Q7 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pacs2Q3V3Q7 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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Pacs2Q3V3Q7 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Pacs2Q3V3Q7 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pacs2Q3V3Q7 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Pacs2Q3V3Q7 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pacs2Q3V3Q7 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pacs2Q3V3Q7 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pacs2Q3V3Q7 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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Pacs2Q3V3Q7 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pacs2Q3V3Q7 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
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Pacs2Q3V3Q7 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pacs2Q3V3Q7 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pacs2Q3V3Q7 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pacs2Q3V3Q7 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pacs2Q3V3Q7 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pacs2Q3V3Q7 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pacs2Q3V3Q7 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pacs2Q3V3Q7 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pacs2Q3V3Q7 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pacs2Q3V3Q7 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pacs2Q3V3Q7 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pacs2Q3V3Q7 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pacs2Q3V3Q7 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pacs2Q3V3Q7 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pacs2Q3V3Q7 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Pacs2Q3V3Q7 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Pacs2Q3V3Q7 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pacs2Q3V3Q7 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pacs2Q3V3Q7 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pacs2Q3V3Q7 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pacs2Q3V3Q7 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pacs2Q3V3Q7 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pacs2Q3V3Q7 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pacs2Q3V3Q7 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pacs2Q3V3Q7 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pacs2Q3V3Q7 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Pacs2Q3V3Q7 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Pacs2Q3V3Q7 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Pacs2Q3V3Q7 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Pacs2Q3V3Q7 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Pacs2Q3V3Q7 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Pacs2Q3V3Q7 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Pacs2Q3V3Q7 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
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