Protein–RNA interactions for Protein: Q9D5T0

Atad1, ATPase family AAA domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 361 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atad1Q9D5T0 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Atad1Q9D5T0 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Atad1Q9D5T0 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Atad1Q9D5T0 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Atad1Q9D5T0 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Atad1Q9D5T0 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Atad1Q9D5T0 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Atad1Q9D5T0 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Atad1Q9D5T0 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Atad1Q9D5T0 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Atad1Q9D5T0 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Atad1Q9D5T0 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Atad1Q9D5T0 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Atad1Q9D5T0 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Atad1Q9D5T0 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Atad1Q9D5T0 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Atad1Q9D5T0 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Atad1Q9D5T0 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Atad1Q9D5T0 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Atad1Q9D5T0 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Atad1Q9D5T0 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Atad1Q9D5T0 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Atad1Q9D5T0 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Atad1Q9D5T0 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Atad1Q9D5T0 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Atad1Q9D5T0 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Atad1Q9D5T0 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Atad1Q9D5T0 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Atad1Q9D5T0 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Atad1Q9D5T0 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Atad1Q9D5T0 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Atad1Q9D5T0 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Atad1Q9D5T0 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Atad1Q9D5T0 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Atad1Q9D5T0 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Atad1Q9D5T0 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Atad1Q9D5T0 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Atad1Q9D5T0 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Atad1Q9D5T0 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Atad1Q9D5T0 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Atad1Q9D5T0 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Atad1Q9D5T0 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Atad1Q9D5T0 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Atad1Q9D5T0 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Atad1Q9D5T0 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Atad1Q9D5T0 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Atad1Q9D5T0 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Atad1Q9D5T0 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Atad1Q9D5T0 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Atad1Q9D5T0 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Atad1Q9D5T0 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Atad1Q9D5T0 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Atad1Q9D5T0 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Atad1Q9D5T0 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Atad1Q9D5T0 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Atad1Q9D5T0 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Atad1Q9D5T0 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Atad1Q9D5T0 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Atad1Q9D5T0 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Atad1Q9D5T0 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Atad1Q9D5T0 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Atad1Q9D5T0 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Atad1Q9D5T0 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Atad1Q9D5T0 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Atad1Q9D5T0 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Atad1Q9D5T0 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Atad1Q9D5T0 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Atad1Q9D5T0 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Atad1Q9D5T0 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Atad1Q9D5T0 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Atad1Q9D5T0 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Atad1Q9D5T0 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Atad1Q9D5T0 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Atad1Q9D5T0 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Atad1Q9D5T0 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Atad1Q9D5T0 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Atad1Q9D5T0 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Atad1Q9D5T0 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Atad1Q9D5T0 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Atad1Q9D5T0 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Atad1Q9D5T0 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Atad1Q9D5T0 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Atad1Q9D5T0 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Atad1Q9D5T0 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Atad1Q9D5T0 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Atad1Q9D5T0 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Atad1Q9D5T0 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Atad1Q9D5T0 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Atad1Q9D5T0 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Atad1Q9D5T0 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Atad1Q9D5T0 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Atad1Q9D5T0 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Atad1Q9D5T0 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Atad1Q9D5T0 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Atad1Q9D5T0 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Atad1Q9D5T0 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Atad1Q9D5T0 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Atad1Q9D5T0 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Atad1Q9D5T0 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Atad1Q9D5T0 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 1046.9 ms