Protein–RNA interactions for Protein: P28741

Kif3a, Kinesin-like protein KIF3A, mousemouse

Predictions only

Length 701 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kif3aP28741 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Kif3aP28741 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Kif3aP28741 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Kif3aP28741 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Kif3aP28741 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Kif3aP28741 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Kif3aP28741 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Kif3aP28741 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Kif3aP28741 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Kif3aP28741 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Kif3aP28741 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Kif3aP28741 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Kif3aP28741 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Kif3aP28741 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Kif3aP28741 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Kif3aP28741 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Kif3aP28741 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Kif3aP28741 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Kif3aP28741 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Kif3aP28741 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Kif3aP28741 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Kif3aP28741 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Kif3aP28741 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Kif3aP28741 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Kif3aP28741 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Kif3aP28741 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Kif3aP28741 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Kif3aP28741 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Kif3aP28741 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Kif3aP28741 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Kif3aP28741 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Kif3aP28741 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Kif3aP28741 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Kif3aP28741 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Kif3aP28741 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Kif3aP28741 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Kif3aP28741 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Kif3aP28741 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Kif3aP28741 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Kif3aP28741 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Kif3aP28741 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Kif3aP28741 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Kif3aP28741 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Kif3aP28741 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Kif3aP28741 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Kif3aP28741 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Kif3aP28741 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Kif3aP28741 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Kif3aP28741 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Kif3aP28741 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Kif3aP28741 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Kif3aP28741 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Kif3aP28741 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Kif3aP28741 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Kif3aP28741 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Kif3aP28741 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Kif3aP28741 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Kif3aP28741 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Kif3aP28741 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Kif3aP28741 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Kif3aP28741 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Kif3aP28741 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Kif3aP28741 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Kif3aP28741 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Kif3aP28741 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Kif3aP28741 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Kif3aP28741 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Kif3aP28741 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Kif3aP28741 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Kif3aP28741 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Kif3aP28741 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Kif3aP28741 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Kif3aP28741 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Kif3aP28741 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Kif3aP28741 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Kif3aP28741 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Kif3aP28741 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Kif3aP28741 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Kif3aP28741 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Kif3aP28741 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Kif3aP28741 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Kif3aP28741 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Kif3aP28741 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Kif3aP28741 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Kif3aP28741 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Kif3aP28741 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Kif3aP28741 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Kif3aP28741 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Kif3aP28741 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Kif3aP28741 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Kif3aP28741 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Kif3aP28741 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Kif3aP28741 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Kif3aP28741 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Kif3aP28741 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Kif3aP28741 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Kif3aP28741 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Kif3aP28741 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Kif3aP28741 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Kif3aP28741 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.2 ms