Protein–RNA interactions for Protein: A0A140LIP3

4933424G06Rik, RIKEN cDNA 4933424G06 gene, mousemouse

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4933424G06RikA0A140LIP3 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
4933424G06RikA0A140LIP3 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
4933424G06RikA0A140LIP3 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
4933424G06RikA0A140LIP3 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
4933424G06RikA0A140LIP3 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
4933424G06RikA0A140LIP3 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
4933424G06RikA0A140LIP3 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
4933424G06RikA0A140LIP3 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
4933424G06RikA0A140LIP3 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
4933424G06RikA0A140LIP3 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
4933424G06RikA0A140LIP3 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
4933424G06RikA0A140LIP3 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
4933424G06RikA0A140LIP3 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
4933424G06RikA0A140LIP3 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
4933424G06RikA0A140LIP3 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
4933424G06RikA0A140LIP3 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
4933424G06RikA0A140LIP3 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
4933424G06RikA0A140LIP3 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
4933424G06RikA0A140LIP3 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
4933424G06RikA0A140LIP3 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
4933424G06RikA0A140LIP3 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
4933424G06RikA0A140LIP3 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
4933424G06RikA0A140LIP3 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
4933424G06RikA0A140LIP3 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC16.14■□□□□ 0.18
4933424G06RikA0A140LIP3 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.18
4933424G06RikA0A140LIP3 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
4933424G06RikA0A140LIP3 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
4933424G06RikA0A140LIP3 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
4933424G06RikA0A140LIP3 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
4933424G06RikA0A140LIP3 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
4933424G06RikA0A140LIP3 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
4933424G06RikA0A140LIP3 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
4933424G06RikA0A140LIP3 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
4933424G06RikA0A140LIP3 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
4933424G06RikA0A140LIP3 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
4933424G06RikA0A140LIP3 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
4933424G06RikA0A140LIP3 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
4933424G06RikA0A140LIP3 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
4933424G06RikA0A140LIP3 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
4933424G06RikA0A140LIP3 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
4933424G06RikA0A140LIP3 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
4933424G06RikA0A140LIP3 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
4933424G06RikA0A140LIP3 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
4933424G06RikA0A140LIP3 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
4933424G06RikA0A140LIP3 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
4933424G06RikA0A140LIP3 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
4933424G06RikA0A140LIP3 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
4933424G06RikA0A140LIP3 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
4933424G06RikA0A140LIP3 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
4933424G06RikA0A140LIP3 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
4933424G06RikA0A140LIP3 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
4933424G06RikA0A140LIP3 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
4933424G06RikA0A140LIP3 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
4933424G06RikA0A140LIP3 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
4933424G06RikA0A140LIP3 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
4933424G06RikA0A140LIP3 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
4933424G06RikA0A140LIP3 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
4933424G06RikA0A140LIP3 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
4933424G06RikA0A140LIP3 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
4933424G06RikA0A140LIP3 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
4933424G06RikA0A140LIP3 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
4933424G06RikA0A140LIP3 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
4933424G06RikA0A140LIP3 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
4933424G06RikA0A140LIP3 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
4933424G06RikA0A140LIP3 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
4933424G06RikA0A140LIP3 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
4933424G06RikA0A140LIP3 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
4933424G06RikA0A140LIP3 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
4933424G06RikA0A140LIP3 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
4933424G06RikA0A140LIP3 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
4933424G06RikA0A140LIP3 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
4933424G06RikA0A140LIP3 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
4933424G06RikA0A140LIP3 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
4933424G06RikA0A140LIP3 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
4933424G06RikA0A140LIP3 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
4933424G06RikA0A140LIP3 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
4933424G06RikA0A140LIP3 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
4933424G06RikA0A140LIP3 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
4933424G06RikA0A140LIP3 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
4933424G06RikA0A140LIP3 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
4933424G06RikA0A140LIP3 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
4933424G06RikA0A140LIP3 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
4933424G06RikA0A140LIP3 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
4933424G06RikA0A140LIP3 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
4933424G06RikA0A140LIP3 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
4933424G06RikA0A140LIP3 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
4933424G06RikA0A140LIP3 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
4933424G06RikA0A140LIP3 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
4933424G06RikA0A140LIP3 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
4933424G06RikA0A140LIP3 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
4933424G06RikA0A140LIP3 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
4933424G06RikA0A140LIP3 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
4933424G06RikA0A140LIP3 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
4933424G06RikA0A140LIP3 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
4933424G06RikA0A140LIP3 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
4933424G06RikA0A140LIP3 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
4933424G06RikA0A140LIP3 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
4933424G06RikA0A140LIP3 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
4933424G06RikA0A140LIP3 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
4933424G06RikA0A140LIP3 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.8 ms