Protein–RNA interactions for Protein: P29974

Cnga1, cGMP-gated cation channel alpha-1, mousemouse

Predictions only

Length 684 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnga1P29974 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Cnga1P29974 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cnga1P29974 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cnga1P29974 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cnga1P29974 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cnga1P29974 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cnga1P29974 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cnga1P29974 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Cnga1P29974 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cnga1P29974 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cnga1P29974 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cnga1P29974 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Cnga1P29974 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cnga1P29974 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cnga1P29974 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cnga1P29974 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cnga1P29974 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cnga1P29974 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cnga1P29974 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
Cnga1P29974 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Cnga1P29974 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC21.52■■□□□ 1.03
Cnga1P29974 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.03
Cnga1P29974 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Cnga1P29974 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
Cnga1P29974 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cnga1P29974 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cnga1P29974 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Cnga1P29974 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cnga1P29974 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cnga1P29974 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cnga1P29974 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Cnga1P29974 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cnga1P29974 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Cnga1P29974 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cnga1P29974 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cnga1P29974 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cnga1P29974 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cnga1P29974 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cnga1P29974 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cnga1P29974 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cnga1P29974 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cnga1P29974 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cnga1P29974 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cnga1P29974 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cnga1P29974 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cnga1P29974 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cnga1P29974 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cnga1P29974 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cnga1P29974 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Cnga1P29974 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cnga1P29974 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cnga1P29974 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cnga1P29974 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cnga1P29974 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cnga1P29974 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cnga1P29974 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cnga1P29974 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cnga1P29974 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cnga1P29974 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cnga1P29974 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cnga1P29974 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cnga1P29974 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cnga1P29974 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cnga1P29974 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cnga1P29974 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cnga1P29974 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cnga1P29974 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cnga1P29974 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cnga1P29974 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cnga1P29974 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cnga1P29974 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cnga1P29974 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Cnga1P29974 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cnga1P29974 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cnga1P29974 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cnga1P29974 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cnga1P29974 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cnga1P29974 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cnga1P29974 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cnga1P29974 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cnga1P29974 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cnga1P29974 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cnga1P29974 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cnga1P29974 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cnga1P29974 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cnga1P29974 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cnga1P29974 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cnga1P29974 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cnga1P29974 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cnga1P29974 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cnga1P29974 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Cnga1P29974 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Cnga1P29974 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cnga1P29974 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cnga1P29974 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cnga1P29974 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cnga1P29974 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cnga1P29974 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cnga1P29974 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cnga1P29974 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.2 ms